Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKB1

Uchl3, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase isozyme L3, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uchl3Q9JKB1 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Uchl3Q9JKB1 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Uchl3Q9JKB1 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Uchl3Q9JKB1 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Uchl3Q9JKB1 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Uchl3Q9JKB1 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Uchl3Q9JKB1 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Uchl3Q9JKB1 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Uchl3Q9JKB1 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Uchl3Q9JKB1 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Uchl3Q9JKB1 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Uchl3Q9JKB1 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Uchl3Q9JKB1 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Uchl3Q9JKB1 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Uchl3Q9JKB1 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Uchl3Q9JKB1 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Uchl3Q9JKB1 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Uchl3Q9JKB1 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Uchl3Q9JKB1 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Uchl3Q9JKB1 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Uchl3Q9JKB1 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Uchl3Q9JKB1 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Uchl3Q9JKB1 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Uchl3Q9JKB1 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Uchl3Q9JKB1 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Uchl3Q9JKB1 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Uchl3Q9JKB1 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Uchl3Q9JKB1 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Uchl3Q9JKB1 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Uchl3Q9JKB1 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Uchl3Q9JKB1 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Uchl3Q9JKB1 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Uchl3Q9JKB1 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Uchl3Q9JKB1 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Uchl3Q9JKB1 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Uchl3Q9JKB1 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Uchl3Q9JKB1 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
Uchl3Q9JKB1 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.59
Uchl3Q9JKB1 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Uchl3Q9JKB1 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Uchl3Q9JKB1 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Uchl3Q9JKB1 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Uchl3Q9JKB1 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Uchl3Q9JKB1 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Uchl3Q9JKB1 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Uchl3Q9JKB1 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Uchl3Q9JKB1 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Uchl3Q9JKB1 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Uchl3Q9JKB1 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Uchl3Q9JKB1 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Uchl3Q9JKB1 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Uchl3Q9JKB1 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Uchl3Q9JKB1 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Uchl3Q9JKB1 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Uchl3Q9JKB1 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Uchl3Q9JKB1 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Uchl3Q9JKB1 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Uchl3Q9JKB1 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Uchl3Q9JKB1 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Uchl3Q9JKB1 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Uchl3Q9JKB1 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Uchl3Q9JKB1 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Uchl3Q9JKB1 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Uchl3Q9JKB1 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Uchl3Q9JKB1 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Uchl3Q9JKB1 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Uchl3Q9JKB1 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Uchl3Q9JKB1 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Uchl3Q9JKB1 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Uchl3Q9JKB1 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Uchl3Q9JKB1 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Uchl3Q9JKB1 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Uchl3Q9JKB1 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Uchl3Q9JKB1 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Uchl3Q9JKB1 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Uchl3Q9JKB1 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Uchl3Q9JKB1 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Uchl3Q9JKB1 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Uchl3Q9JKB1 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Uchl3Q9JKB1 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Uchl3Q9JKB1 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Uchl3Q9JKB1 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Uchl3Q9JKB1 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Uchl3Q9JKB1 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Uchl3Q9JKB1 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Uchl3Q9JKB1 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Uchl3Q9JKB1 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Uchl3Q9JKB1 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Uchl3Q9JKB1 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Uchl3Q9JKB1 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Uchl3Q9JKB1 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Uchl3Q9JKB1 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Uchl3Q9JKB1 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Uchl3Q9JKB1 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Uchl3Q9JKB1 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Uchl3Q9JKB1 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Uchl3Q9JKB1 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Uchl3Q9JKB1 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Uchl3Q9JKB1 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Uchl3Q9JKB1 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms