Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJW6

Alyref2, Aly/REF export factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Alyref2Q9JJW6 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Alyref2Q9JJW6 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Alyref2Q9JJW6 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Alyref2Q9JJW6 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Alyref2Q9JJW6 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Alyref2Q9JJW6 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Alyref2Q9JJW6 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Alyref2Q9JJW6 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Alyref2Q9JJW6 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Alyref2Q9JJW6 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Alyref2Q9JJW6 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Alyref2Q9JJW6 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Alyref2Q9JJW6 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Alyref2Q9JJW6 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Alyref2Q9JJW6 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Alyref2Q9JJW6 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Alyref2Q9JJW6 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Alyref2Q9JJW6 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Alyref2Q9JJW6 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Alyref2Q9JJW6 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Alyref2Q9JJW6 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Alyref2Q9JJW6 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Alyref2Q9JJW6 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Alyref2Q9JJW6 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Alyref2Q9JJW6 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Alyref2Q9JJW6 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Alyref2Q9JJW6 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Alyref2Q9JJW6 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Alyref2Q9JJW6 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Alyref2Q9JJW6 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Alyref2Q9JJW6 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Alyref2Q9JJW6 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Alyref2Q9JJW6 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Alyref2Q9JJW6 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Alyref2Q9JJW6 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Alyref2Q9JJW6 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Alyref2Q9JJW6 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Alyref2Q9JJW6 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Alyref2Q9JJW6 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Alyref2Q9JJW6 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Alyref2Q9JJW6 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Alyref2Q9JJW6 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Alyref2Q9JJW6 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Alyref2Q9JJW6 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Alyref2Q9JJW6 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Alyref2Q9JJW6 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Alyref2Q9JJW6 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Alyref2Q9JJW6 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Alyref2Q9JJW6 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Alyref2Q9JJW6 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Alyref2Q9JJW6 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Alyref2Q9JJW6 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Alyref2Q9JJW6 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Alyref2Q9JJW6 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Alyref2Q9JJW6 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Alyref2Q9JJW6 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Alyref2Q9JJW6 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Alyref2Q9JJW6 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Alyref2Q9JJW6 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Alyref2Q9JJW6 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Alyref2Q9JJW6 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Alyref2Q9JJW6 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Alyref2Q9JJW6 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Alyref2Q9JJW6 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Alyref2Q9JJW6 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Alyref2Q9JJW6 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Alyref2Q9JJW6 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Alyref2Q9JJW6 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Alyref2Q9JJW6 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Alyref2Q9JJW6 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Alyref2Q9JJW6 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Alyref2Q9JJW6 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Alyref2Q9JJW6 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Alyref2Q9JJW6 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Alyref2Q9JJW6 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Alyref2Q9JJW6 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Alyref2Q9JJW6 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Alyref2Q9JJW6 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Alyref2Q9JJW6 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Alyref2Q9JJW6 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Alyref2Q9JJW6 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Alyref2Q9JJW6 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Alyref2Q9JJW6 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Alyref2Q9JJW6 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Alyref2Q9JJW6 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Alyref2Q9JJW6 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Alyref2Q9JJW6 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Alyref2Q9JJW6 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Alyref2Q9JJW6 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Alyref2Q9JJW6 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Alyref2Q9JJW6 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Alyref2Q9JJW6 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Alyref2Q9JJW6 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Alyref2Q9JJW6 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Alyref2Q9JJW6 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Alyref2Q9JJW6 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Alyref2Q9JJW6 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Alyref2Q9JJW6 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Alyref2Q9JJW6 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Alyref2Q9JJW6 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
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