Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJS0

Scube2, Signal peptide, CUB and EGF-like domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 997 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scube2Q9JJS0 Gm26787-201ENSMUST00000180474 608 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Scube2Q9JJS0 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Scube2Q9JJS0 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Scube2Q9JJS0 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Scube2Q9JJS0 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Scube2Q9JJS0 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Scube2Q9JJS0 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Scube2Q9JJS0 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Scube2Q9JJS0 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Scube2Q9JJS0 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Scube2Q9JJS0 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Scube2Q9JJS0 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Scube2Q9JJS0 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Scube2Q9JJS0 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Scube2Q9JJS0 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Scube2Q9JJS0 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Scube2Q9JJS0 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Scube2Q9JJS0 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Scube2Q9JJS0 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Scube2Q9JJS0 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Scube2Q9JJS0 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Scube2Q9JJS0 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Scube2Q9JJS0 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Scube2Q9JJS0 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Scube2Q9JJS0 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Scube2Q9JJS0 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Scube2Q9JJS0 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Scube2Q9JJS0 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Scube2Q9JJS0 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Scube2Q9JJS0 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Scube2Q9JJS0 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Scube2Q9JJS0 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Scube2Q9JJS0 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Scube2Q9JJS0 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Scube2Q9JJS0 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Scube2Q9JJS0 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Scube2Q9JJS0 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Scube2Q9JJS0 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Scube2Q9JJS0 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Scube2Q9JJS0 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Scube2Q9JJS0 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Scube2Q9JJS0 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Scube2Q9JJS0 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Scube2Q9JJS0 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Scube2Q9JJS0 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Scube2Q9JJS0 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Scube2Q9JJS0 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Scube2Q9JJS0 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Scube2Q9JJS0 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Scube2Q9JJS0 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Scube2Q9JJS0 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Scube2Q9JJS0 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Scube2Q9JJS0 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Scube2Q9JJS0 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Scube2Q9JJS0 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Scube2Q9JJS0 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Scube2Q9JJS0 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Scube2Q9JJS0 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Scube2Q9JJS0 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Scube2Q9JJS0 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Scube2Q9JJS0 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Scube2Q9JJS0 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Scube2Q9JJS0 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Scube2Q9JJS0 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Scube2Q9JJS0 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Scube2Q9JJS0 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Scube2Q9JJS0 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Scube2Q9JJS0 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Scube2Q9JJS0 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Scube2Q9JJS0 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Scube2Q9JJS0 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Scube2Q9JJS0 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Scube2Q9JJS0 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Scube2Q9JJS0 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Scube2Q9JJS0 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Scube2Q9JJS0 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Scube2Q9JJS0 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Scube2Q9JJS0 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Scube2Q9JJS0 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Scube2Q9JJS0 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Scube2Q9JJS0 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Scube2Q9JJS0 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Scube2Q9JJS0 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Scube2Q9JJS0 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Scube2Q9JJS0 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Scube2Q9JJS0 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Scube2Q9JJS0 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Scube2Q9JJS0 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Scube2Q9JJS0 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Scube2Q9JJS0 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Scube2Q9JJS0 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Scube2Q9JJS0 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Scube2Q9JJS0 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Scube2Q9JJS0 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Scube2Q9JJS0 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Scube2Q9JJS0 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Scube2Q9JJS0 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Scube2Q9JJS0 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Scube2Q9JJS0 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Scube2Q9JJS0 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.8 ms