Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJ57

Kcnip1, Kv channel-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnip1Q9JJ57 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Kcnip1Q9JJ57 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Kcnip1Q9JJ57 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Kcnip1Q9JJ57 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Kcnip1Q9JJ57 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Kcnip1Q9JJ57 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Kcnip1Q9JJ57 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Kcnip1Q9JJ57 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Kcnip1Q9JJ57 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Kcnip1Q9JJ57 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Kcnip1Q9JJ57 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Kcnip1Q9JJ57 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Kcnip1Q9JJ57 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Kcnip1Q9JJ57 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Kcnip1Q9JJ57 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Kcnip1Q9JJ57 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Kcnip1Q9JJ57 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Kcnip1Q9JJ57 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Kcnip1Q9JJ57 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Kcnip1Q9JJ57 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Kcnip1Q9JJ57 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Kcnip1Q9JJ57 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Kcnip1Q9JJ57 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Kcnip1Q9JJ57 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Kcnip1Q9JJ57 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Kcnip1Q9JJ57 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Kcnip1Q9JJ57 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Kcnip1Q9JJ57 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Kcnip1Q9JJ57 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Kcnip1Q9JJ57 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Kcnip1Q9JJ57 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Kcnip1Q9JJ57 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Kcnip1Q9JJ57 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Kcnip1Q9JJ57 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Kcnip1Q9JJ57 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Kcnip1Q9JJ57 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Kcnip1Q9JJ57 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Kcnip1Q9JJ57 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Kcnip1Q9JJ57 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Kcnip1Q9JJ57 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Kcnip1Q9JJ57 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Kcnip1Q9JJ57 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Kcnip1Q9JJ57 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Kcnip1Q9JJ57 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Kcnip1Q9JJ57 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Kcnip1Q9JJ57 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Kcnip1Q9JJ57 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Kcnip1Q9JJ57 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Kcnip1Q9JJ57 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Kcnip1Q9JJ57 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Kcnip1Q9JJ57 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Kcnip1Q9JJ57 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Kcnip1Q9JJ57 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Kcnip1Q9JJ57 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Kcnip1Q9JJ57 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Kcnip1Q9JJ57 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Kcnip1Q9JJ57 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Kcnip1Q9JJ57 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Kcnip1Q9JJ57 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Kcnip1Q9JJ57 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Kcnip1Q9JJ57 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Kcnip1Q9JJ57 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Kcnip1Q9JJ57 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Kcnip1Q9JJ57 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Kcnip1Q9JJ57 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Kcnip1Q9JJ57 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Kcnip1Q9JJ57 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Kcnip1Q9JJ57 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Kcnip1Q9JJ57 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Kcnip1Q9JJ57 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Kcnip1Q9JJ57 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Kcnip1Q9JJ57 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Kcnip1Q9JJ57 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Kcnip1Q9JJ57 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Kcnip1Q9JJ57 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Kcnip1Q9JJ57 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Kcnip1Q9JJ57 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Kcnip1Q9JJ57 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Kcnip1Q9JJ57 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Kcnip1Q9JJ57 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Kcnip1Q9JJ57 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Kcnip1Q9JJ57 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Kcnip1Q9JJ57 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Kcnip1Q9JJ57 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Kcnip1Q9JJ57 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Kcnip1Q9JJ57 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Kcnip1Q9JJ57 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Kcnip1Q9JJ57 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Kcnip1Q9JJ57 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Kcnip1Q9JJ57 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Kcnip1Q9JJ57 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Kcnip1Q9JJ57 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Kcnip1Q9JJ57 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Kcnip1Q9JJ57 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Kcnip1Q9JJ57 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Kcnip1Q9JJ57 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Kcnip1Q9JJ57 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Kcnip1Q9JJ57 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Kcnip1Q9JJ57 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Kcnip1Q9JJ57 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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