Protein–RNA interactions for Protein: Q9ET54

Palld, Palladin, mousemouse

Predictions only

Length 1,408 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PalldQ9ET54 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PalldQ9ET54 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PalldQ9ET54 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PalldQ9ET54 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PalldQ9ET54 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PalldQ9ET54 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PalldQ9ET54 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
PalldQ9ET54 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
PalldQ9ET54 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PalldQ9ET54 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
PalldQ9ET54 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PalldQ9ET54 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PalldQ9ET54 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PalldQ9ET54 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PalldQ9ET54 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PalldQ9ET54 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
PalldQ9ET54 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PalldQ9ET54 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PalldQ9ET54 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PalldQ9ET54 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PalldQ9ET54 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PalldQ9ET54 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
PalldQ9ET54 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PalldQ9ET54 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PalldQ9ET54 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PalldQ9ET54 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
PalldQ9ET54 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PalldQ9ET54 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PalldQ9ET54 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
PalldQ9ET54 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PalldQ9ET54 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PalldQ9ET54 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PalldQ9ET54 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PalldQ9ET54 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PalldQ9ET54 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PalldQ9ET54 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
PalldQ9ET54 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PalldQ9ET54 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PalldQ9ET54 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PalldQ9ET54 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PalldQ9ET54 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PalldQ9ET54 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PalldQ9ET54 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PalldQ9ET54 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PalldQ9ET54 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PalldQ9ET54 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PalldQ9ET54 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PalldQ9ET54 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PalldQ9ET54 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PalldQ9ET54 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PalldQ9ET54 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PalldQ9ET54 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PalldQ9ET54 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PalldQ9ET54 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PalldQ9ET54 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PalldQ9ET54 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PalldQ9ET54 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PalldQ9ET54 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PalldQ9ET54 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PalldQ9ET54 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PalldQ9ET54 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PalldQ9ET54 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
PalldQ9ET54 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PalldQ9ET54 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PalldQ9ET54 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PalldQ9ET54 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PalldQ9ET54 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PalldQ9ET54 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PalldQ9ET54 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PalldQ9ET54 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PalldQ9ET54 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PalldQ9ET54 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PalldQ9ET54 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PalldQ9ET54 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PalldQ9ET54 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PalldQ9ET54 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
PalldQ9ET54 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PalldQ9ET54 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PalldQ9ET54 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PalldQ9ET54 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PalldQ9ET54 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PalldQ9ET54 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PalldQ9ET54 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PalldQ9ET54 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PalldQ9ET54 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PalldQ9ET54 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PalldQ9ET54 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PalldQ9ET54 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
PalldQ9ET54 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
PalldQ9ET54 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.51
PalldQ9ET54 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC24.45■■□□□ 1.51
PalldQ9ET54 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
PalldQ9ET54 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC24.45■■□□□ 1.51
PalldQ9ET54 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
PalldQ9ET54 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PalldQ9ET54 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PalldQ9ET54 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PalldQ9ET54 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PalldQ9ET54 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PalldQ9ET54 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms