Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESN2

Trim39, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM39, mousemouse

Predictions only

Length 488 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim39Q9ESN2 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trim39Q9ESN2 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trim39Q9ESN2 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Trim39Q9ESN2 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trim39Q9ESN2 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trim39Q9ESN2 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trim39Q9ESN2 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trim39Q9ESN2 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trim39Q9ESN2 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trim39Q9ESN2 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trim39Q9ESN2 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trim39Q9ESN2 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trim39Q9ESN2 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trim39Q9ESN2 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trim39Q9ESN2 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trim39Q9ESN2 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trim39Q9ESN2 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trim39Q9ESN2 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trim39Q9ESN2 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trim39Q9ESN2 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trim39Q9ESN2 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trim39Q9ESN2 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trim39Q9ESN2 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trim39Q9ESN2 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trim39Q9ESN2 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trim39Q9ESN2 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trim39Q9ESN2 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trim39Q9ESN2 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trim39Q9ESN2 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trim39Q9ESN2 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trim39Q9ESN2 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trim39Q9ESN2 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trim39Q9ESN2 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trim39Q9ESN2 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trim39Q9ESN2 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trim39Q9ESN2 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trim39Q9ESN2 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trim39Q9ESN2 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trim39Q9ESN2 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trim39Q9ESN2 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trim39Q9ESN2 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trim39Q9ESN2 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trim39Q9ESN2 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trim39Q9ESN2 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trim39Q9ESN2 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trim39Q9ESN2 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Trim39Q9ESN2 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trim39Q9ESN2 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trim39Q9ESN2 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trim39Q9ESN2 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trim39Q9ESN2 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trim39Q9ESN2 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trim39Q9ESN2 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trim39Q9ESN2 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trim39Q9ESN2 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Trim39Q9ESN2 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trim39Q9ESN2 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trim39Q9ESN2 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trim39Q9ESN2 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trim39Q9ESN2 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trim39Q9ESN2 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Trim39Q9ESN2 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trim39Q9ESN2 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trim39Q9ESN2 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trim39Q9ESN2 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trim39Q9ESN2 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trim39Q9ESN2 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trim39Q9ESN2 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trim39Q9ESN2 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trim39Q9ESN2 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trim39Q9ESN2 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trim39Q9ESN2 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Trim39Q9ESN2 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trim39Q9ESN2 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trim39Q9ESN2 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Trim39Q9ESN2 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Trim39Q9ESN2 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trim39Q9ESN2 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trim39Q9ESN2 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Trim39Q9ESN2 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trim39Q9ESN2 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trim39Q9ESN2 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trim39Q9ESN2 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trim39Q9ESN2 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trim39Q9ESN2 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trim39Q9ESN2 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trim39Q9ESN2 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trim39Q9ESN2 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trim39Q9ESN2 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trim39Q9ESN2 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trim39Q9ESN2 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trim39Q9ESN2 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trim39Q9ESN2 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trim39Q9ESN2 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trim39Q9ESN2 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trim39Q9ESN2 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trim39Q9ESN2 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trim39Q9ESN2 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trim39Q9ESN2 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trim39Q9ESN2 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
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