Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESD7

Dysf, Dysferlin, mousemouse

Predictions only

Length 2,090 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DysfQ9ESD7 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
DysfQ9ESD7 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
DysfQ9ESD7 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
DysfQ9ESD7 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
DysfQ9ESD7 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
DysfQ9ESD7 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
DysfQ9ESD7 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
DysfQ9ESD7 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
DysfQ9ESD7 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
DysfQ9ESD7 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
DysfQ9ESD7 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
DysfQ9ESD7 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
DysfQ9ESD7 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC15.02■□□□□ -0
DysfQ9ESD7 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
DysfQ9ESD7 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
DysfQ9ESD7 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
DysfQ9ESD7 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
DysfQ9ESD7 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
DysfQ9ESD7 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
DysfQ9ESD7 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
DysfQ9ESD7 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
DysfQ9ESD7 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
DysfQ9ESD7 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
DysfQ9ESD7 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
DysfQ9ESD7 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
DysfQ9ESD7 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
DysfQ9ESD7 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
DysfQ9ESD7 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC15.02□□□□□ -0.01
DysfQ9ESD7 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
DysfQ9ESD7 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
DysfQ9ESD7 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
DysfQ9ESD7 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
DysfQ9ESD7 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
DysfQ9ESD7 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
DysfQ9ESD7 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
DysfQ9ESD7 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
DysfQ9ESD7 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
DysfQ9ESD7 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
DysfQ9ESD7 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
DysfQ9ESD7 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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DysfQ9ESD7 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
DysfQ9ESD7 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
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DysfQ9ESD7 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
DysfQ9ESD7 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
DysfQ9ESD7 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
DysfQ9ESD7 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
DysfQ9ESD7 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
DysfQ9ESD7 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
DysfQ9ESD7 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
DysfQ9ESD7 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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DysfQ9ESD7 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
DysfQ9ESD7 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC15□□□□□ -0.01
DysfQ9ESD7 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
DysfQ9ESD7 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
DysfQ9ESD7 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
DysfQ9ESD7 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
DysfQ9ESD7 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
DysfQ9ESD7 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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DysfQ9ESD7 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
DysfQ9ESD7 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
DysfQ9ESD7 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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DysfQ9ESD7 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
DysfQ9ESD7 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
DysfQ9ESD7 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
DysfQ9ESD7 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
DysfQ9ESD7 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
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DysfQ9ESD7 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
DysfQ9ESD7 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
DysfQ9ESD7 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
DysfQ9ESD7 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
DysfQ9ESD7 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
DysfQ9ESD7 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
DysfQ9ESD7 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
DysfQ9ESD7 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
DysfQ9ESD7 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
DysfQ9ESD7 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
DysfQ9ESD7 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
DysfQ9ESD7 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
DysfQ9ESD7 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
DysfQ9ESD7 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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