Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES64

Ush1c, Harmonin, mousemouse

Predictions only

Length 910 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ush1cQ9ES64 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ush1cQ9ES64 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Ush1cQ9ES64 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ush1cQ9ES64 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ush1cQ9ES64 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ush1cQ9ES64 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ush1cQ9ES64 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ush1cQ9ES64 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ush1cQ9ES64 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ush1cQ9ES64 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ush1cQ9ES64 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ush1cQ9ES64 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Ush1cQ9ES64 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ush1cQ9ES64 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ush1cQ9ES64 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ush1cQ9ES64 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ush1cQ9ES64 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ush1cQ9ES64 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ush1cQ9ES64 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ush1cQ9ES64 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ush1cQ9ES64 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ush1cQ9ES64 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ush1cQ9ES64 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ush1cQ9ES64 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ush1cQ9ES64 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ush1cQ9ES64 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ush1cQ9ES64 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ush1cQ9ES64 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ush1cQ9ES64 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ush1cQ9ES64 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ush1cQ9ES64 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ush1cQ9ES64 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ush1cQ9ES64 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ush1cQ9ES64 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ush1cQ9ES64 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Ush1cQ9ES64 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ush1cQ9ES64 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ush1cQ9ES64 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ush1cQ9ES64 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ush1cQ9ES64 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ush1cQ9ES64 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ush1cQ9ES64 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ush1cQ9ES64 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ush1cQ9ES64 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ush1cQ9ES64 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ush1cQ9ES64 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ush1cQ9ES64 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ush1cQ9ES64 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ush1cQ9ES64 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ush1cQ9ES64 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Ush1cQ9ES64 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ush1cQ9ES64 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ush1cQ9ES64 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ush1cQ9ES64 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Ush1cQ9ES64 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ush1cQ9ES64 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ush1cQ9ES64 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ush1cQ9ES64 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ush1cQ9ES64 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ush1cQ9ES64 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ush1cQ9ES64 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ush1cQ9ES64 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ush1cQ9ES64 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ush1cQ9ES64 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ush1cQ9ES64 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ush1cQ9ES64 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Ush1cQ9ES64 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ush1cQ9ES64 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ush1cQ9ES64 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ush1cQ9ES64 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ush1cQ9ES64 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ush1cQ9ES64 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ush1cQ9ES64 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ush1cQ9ES64 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ush1cQ9ES64 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ush1cQ9ES64 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ush1cQ9ES64 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ush1cQ9ES64 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ush1cQ9ES64 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ush1cQ9ES64 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ush1cQ9ES64 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ush1cQ9ES64 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ush1cQ9ES64 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ush1cQ9ES64 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ush1cQ9ES64 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ush1cQ9ES64 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ush1cQ9ES64 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ush1cQ9ES64 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ush1cQ9ES64 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ush1cQ9ES64 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ush1cQ9ES64 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ush1cQ9ES64 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ush1cQ9ES64 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ush1cQ9ES64 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ush1cQ9ES64 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ush1cQ9ES64 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ush1cQ9ES64 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ush1cQ9ES64 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ush1cQ9ES64 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ush1cQ9ES64 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39 ms