Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERK7

Chrnb2, Neuronal acetylcholine receptor subunit beta-2, mousemouse

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chrnb2Q9ERK7 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Chrnb2Q9ERK7 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Chrnb2Q9ERK7 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Chrnb2Q9ERK7 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Chrnb2Q9ERK7 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Chrnb2Q9ERK7 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Chrnb2Q9ERK7 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Chrnb2Q9ERK7 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Chrnb2Q9ERK7 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Chrnb2Q9ERK7 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Chrnb2Q9ERK7 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Chrnb2Q9ERK7 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Chrnb2Q9ERK7 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Chrnb2Q9ERK7 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Chrnb2Q9ERK7 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Chrnb2Q9ERK7 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Chrnb2Q9ERK7 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Chrnb2Q9ERK7 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Chrnb2Q9ERK7 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Chrnb2Q9ERK7 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Chrnb2Q9ERK7 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Chrnb2Q9ERK7 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Chrnb2Q9ERK7 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Chrnb2Q9ERK7 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Chrnb2Q9ERK7 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Chrnb2Q9ERK7 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Chrnb2Q9ERK7 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Chrnb2Q9ERK7 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Chrnb2Q9ERK7 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Chrnb2Q9ERK7 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Chrnb2Q9ERK7 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Chrnb2Q9ERK7 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Chrnb2Q9ERK7 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Chrnb2Q9ERK7 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Chrnb2Q9ERK7 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Chrnb2Q9ERK7 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Chrnb2Q9ERK7 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Chrnb2Q9ERK7 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Chrnb2Q9ERK7 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Chrnb2Q9ERK7 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Chrnb2Q9ERK7 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Chrnb2Q9ERK7 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Chrnb2Q9ERK7 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Chrnb2Q9ERK7 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Chrnb2Q9ERK7 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Chrnb2Q9ERK7 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Chrnb2Q9ERK7 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Chrnb2Q9ERK7 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Chrnb2Q9ERK7 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Chrnb2Q9ERK7 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Chrnb2Q9ERK7 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Chrnb2Q9ERK7 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Chrnb2Q9ERK7 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Chrnb2Q9ERK7 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Chrnb2Q9ERK7 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Chrnb2Q9ERK7 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Chrnb2Q9ERK7 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Chrnb2Q9ERK7 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Chrnb2Q9ERK7 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Chrnb2Q9ERK7 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Chrnb2Q9ERK7 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Chrnb2Q9ERK7 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Chrnb2Q9ERK7 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Chrnb2Q9ERK7 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Chrnb2Q9ERK7 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Chrnb2Q9ERK7 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Chrnb2Q9ERK7 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Chrnb2Q9ERK7 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Chrnb2Q9ERK7 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Chrnb2Q9ERK7 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Chrnb2Q9ERK7 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Chrnb2Q9ERK7 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Chrnb2Q9ERK7 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Chrnb2Q9ERK7 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Chrnb2Q9ERK7 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Chrnb2Q9ERK7 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Chrnb2Q9ERK7 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Chrnb2Q9ERK7 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Chrnb2Q9ERK7 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Chrnb2Q9ERK7 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Chrnb2Q9ERK7 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Chrnb2Q9ERK7 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Chrnb2Q9ERK7 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Chrnb2Q9ERK7 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Chrnb2Q9ERK7 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Chrnb2Q9ERK7 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Chrnb2Q9ERK7 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Chrnb2Q9ERK7 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Chrnb2Q9ERK7 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Chrnb2Q9ERK7 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Chrnb2Q9ERK7 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Chrnb2Q9ERK7 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Chrnb2Q9ERK7 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Chrnb2Q9ERK7 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Chrnb2Q9ERK7 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Chrnb2Q9ERK7 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Chrnb2Q9ERK7 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Chrnb2Q9ERK7 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Chrnb2Q9ERK7 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Chrnb2Q9ERK7 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49 ms