Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERA6

Tfip11, Tuftelin-interacting protein 11, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 838 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tfip11Q9ERA6 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tfip11Q9ERA6 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tfip11Q9ERA6 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tfip11Q9ERA6 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tfip11Q9ERA6 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tfip11Q9ERA6 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tfip11Q9ERA6 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tfip11Q9ERA6 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tfip11Q9ERA6 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tfip11Q9ERA6 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tfip11Q9ERA6 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tfip11Q9ERA6 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tfip11Q9ERA6 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Tfip11Q9ERA6 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Tfip11Q9ERA6 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tfip11Q9ERA6 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tfip11Q9ERA6 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tfip11Q9ERA6 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tfip11Q9ERA6 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tfip11Q9ERA6 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tfip11Q9ERA6 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tfip11Q9ERA6 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tfip11Q9ERA6 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tfip11Q9ERA6 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tfip11Q9ERA6 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Tfip11Q9ERA6 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tfip11Q9ERA6 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tfip11Q9ERA6 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tfip11Q9ERA6 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tfip11Q9ERA6 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tfip11Q9ERA6 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tfip11Q9ERA6 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tfip11Q9ERA6 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tfip11Q9ERA6 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tfip11Q9ERA6 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tfip11Q9ERA6 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tfip11Q9ERA6 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tfip11Q9ERA6 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tfip11Q9ERA6 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tfip11Q9ERA6 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tfip11Q9ERA6 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tfip11Q9ERA6 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Tfip11Q9ERA6 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tfip11Q9ERA6 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tfip11Q9ERA6 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tfip11Q9ERA6 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tfip11Q9ERA6 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tfip11Q9ERA6 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tfip11Q9ERA6 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Tfip11Q9ERA6 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tfip11Q9ERA6 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tfip11Q9ERA6 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tfip11Q9ERA6 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tfip11Q9ERA6 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tfip11Q9ERA6 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tfip11Q9ERA6 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tfip11Q9ERA6 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tfip11Q9ERA6 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tfip11Q9ERA6 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tfip11Q9ERA6 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tfip11Q9ERA6 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tfip11Q9ERA6 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Tfip11Q9ERA6 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tfip11Q9ERA6 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tfip11Q9ERA6 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tfip11Q9ERA6 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Tfip11Q9ERA6 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Tfip11Q9ERA6 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Tfip11Q9ERA6 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Tfip11Q9ERA6 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Tfip11Q9ERA6 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Tfip11Q9ERA6 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Tfip11Q9ERA6 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Tfip11Q9ERA6 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Tfip11Q9ERA6 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Tfip11Q9ERA6 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Tfip11Q9ERA6 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tfip11Q9ERA6 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tfip11Q9ERA6 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tfip11Q9ERA6 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tfip11Q9ERA6 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tfip11Q9ERA6 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tfip11Q9ERA6 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tfip11Q9ERA6 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tfip11Q9ERA6 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Tfip11Q9ERA6 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tfip11Q9ERA6 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tfip11Q9ERA6 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tfip11Q9ERA6 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tfip11Q9ERA6 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tfip11Q9ERA6 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tfip11Q9ERA6 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tfip11Q9ERA6 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tfip11Q9ERA6 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tfip11Q9ERA6 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tfip11Q9ERA6 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tfip11Q9ERA6 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tfip11Q9ERA6 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tfip11Q9ERA6 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tfip11Q9ERA6 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms