Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPL2

Clstn1, Calsyntenin-1, mousemouse

Predictions only

Length 979 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clstn1Q9EPL2 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Clstn1Q9EPL2 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Clstn1Q9EPL2 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Clstn1Q9EPL2 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Clstn1Q9EPL2 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Clstn1Q9EPL2 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Clstn1Q9EPL2 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Clstn1Q9EPL2 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Clstn1Q9EPL2 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Clstn1Q9EPL2 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Clstn1Q9EPL2 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Clstn1Q9EPL2 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Clstn1Q9EPL2 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Clstn1Q9EPL2 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Clstn1Q9EPL2 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Clstn1Q9EPL2 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Clstn1Q9EPL2 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Clstn1Q9EPL2 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Clstn1Q9EPL2 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Clstn1Q9EPL2 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Clstn1Q9EPL2 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Clstn1Q9EPL2 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Clstn1Q9EPL2 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Clstn1Q9EPL2 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Clstn1Q9EPL2 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Clstn1Q9EPL2 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Clstn1Q9EPL2 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Clstn1Q9EPL2 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Clstn1Q9EPL2 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Clstn1Q9EPL2 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
Clstn1Q9EPL2 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Clstn1Q9EPL2 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Clstn1Q9EPL2 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Clstn1Q9EPL2 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Clstn1Q9EPL2 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Clstn1Q9EPL2 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Clstn1Q9EPL2 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
Clstn1Q9EPL2 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Clstn1Q9EPL2 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Clstn1Q9EPL2 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Clstn1Q9EPL2 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Clstn1Q9EPL2 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Clstn1Q9EPL2 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Clstn1Q9EPL2 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Clstn1Q9EPL2 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Clstn1Q9EPL2 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Clstn1Q9EPL2 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Clstn1Q9EPL2 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Clstn1Q9EPL2 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Clstn1Q9EPL2 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Clstn1Q9EPL2 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Clstn1Q9EPL2 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Clstn1Q9EPL2 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Clstn1Q9EPL2 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Clstn1Q9EPL2 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Clstn1Q9EPL2 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Clstn1Q9EPL2 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Clstn1Q9EPL2 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Clstn1Q9EPL2 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Clstn1Q9EPL2 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Clstn1Q9EPL2 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
Clstn1Q9EPL2 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
Clstn1Q9EPL2 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Clstn1Q9EPL2 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Clstn1Q9EPL2 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Clstn1Q9EPL2 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
Clstn1Q9EPL2 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Clstn1Q9EPL2 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Clstn1Q9EPL2 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Clstn1Q9EPL2 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
Clstn1Q9EPL2 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Clstn1Q9EPL2 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Clstn1Q9EPL2 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
Clstn1Q9EPL2 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Clstn1Q9EPL2 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Clstn1Q9EPL2 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Clstn1Q9EPL2 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Clstn1Q9EPL2 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Clstn1Q9EPL2 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Clstn1Q9EPL2 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Clstn1Q9EPL2 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC20.95■□□□□ 0.95
Clstn1Q9EPL2 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Clstn1Q9EPL2 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Clstn1Q9EPL2 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
Clstn1Q9EPL2 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Clstn1Q9EPL2 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Clstn1Q9EPL2 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Clstn1Q9EPL2 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Clstn1Q9EPL2 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Clstn1Q9EPL2 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Clstn1Q9EPL2 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Clstn1Q9EPL2 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Clstn1Q9EPL2 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
Clstn1Q9EPL2 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Clstn1Q9EPL2 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
Clstn1Q9EPL2 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Clstn1Q9EPL2 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Clstn1Q9EPL2 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Clstn1Q9EPL2 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
Clstn1Q9EPL2 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.7 ms