Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPK2

Rp2, Protein XRP2, mousemouse

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rp2Q9EPK2 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rp2Q9EPK2 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rp2Q9EPK2 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rp2Q9EPK2 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Rp2Q9EPK2 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rp2Q9EPK2 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rp2Q9EPK2 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rp2Q9EPK2 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rp2Q9EPK2 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rp2Q9EPK2 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rp2Q9EPK2 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rp2Q9EPK2 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rp2Q9EPK2 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rp2Q9EPK2 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rp2Q9EPK2 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rp2Q9EPK2 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rp2Q9EPK2 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rp2Q9EPK2 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rp2Q9EPK2 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rp2Q9EPK2 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rp2Q9EPK2 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rp2Q9EPK2 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rp2Q9EPK2 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rp2Q9EPK2 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rp2Q9EPK2 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rp2Q9EPK2 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rp2Q9EPK2 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rp2Q9EPK2 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rp2Q9EPK2 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rp2Q9EPK2 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rp2Q9EPK2 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rp2Q9EPK2 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Rp2Q9EPK2 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rp2Q9EPK2 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rp2Q9EPK2 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rp2Q9EPK2 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rp2Q9EPK2 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Rp2Q9EPK2 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rp2Q9EPK2 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rp2Q9EPK2 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rp2Q9EPK2 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Rp2Q9EPK2 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rp2Q9EPK2 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Rp2Q9EPK2 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rp2Q9EPK2 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Rp2Q9EPK2 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rp2Q9EPK2 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rp2Q9EPK2 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rp2Q9EPK2 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rp2Q9EPK2 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rp2Q9EPK2 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rp2Q9EPK2 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rp2Q9EPK2 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rp2Q9EPK2 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rp2Q9EPK2 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rp2Q9EPK2 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rp2Q9EPK2 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rp2Q9EPK2 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rp2Q9EPK2 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Rp2Q9EPK2 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rp2Q9EPK2 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rp2Q9EPK2 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rp2Q9EPK2 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rp2Q9EPK2 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rp2Q9EPK2 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rp2Q9EPK2 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rp2Q9EPK2 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rp2Q9EPK2 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rp2Q9EPK2 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rp2Q9EPK2 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rp2Q9EPK2 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rp2Q9EPK2 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rp2Q9EPK2 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Rp2Q9EPK2 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rp2Q9EPK2 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rp2Q9EPK2 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rp2Q9EPK2 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rp2Q9EPK2 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rp2Q9EPK2 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rp2Q9EPK2 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rp2Q9EPK2 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rp2Q9EPK2 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rp2Q9EPK2 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rp2Q9EPK2 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rp2Q9EPK2 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rp2Q9EPK2 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rp2Q9EPK2 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rp2Q9EPK2 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rp2Q9EPK2 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rp2Q9EPK2 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Rp2Q9EPK2 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Rp2Q9EPK2 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Rp2Q9EPK2 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Rp2Q9EPK2 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Rp2Q9EPK2 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Rp2Q9EPK2 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Rp2Q9EPK2 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Rp2Q9EPK2 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rp2Q9EPK2 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rp2Q9EPK2 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.8 ms