Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPJ9

Arfgap1, ADP-ribosylation factor GTPase-activating protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 414 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arfgap1Q9EPJ9 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Arfgap1Q9EPJ9 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Arfgap1Q9EPJ9 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Arfgap1Q9EPJ9 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Arfgap1Q9EPJ9 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Arfgap1Q9EPJ9 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Arfgap1Q9EPJ9 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Arfgap1Q9EPJ9 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Arfgap1Q9EPJ9 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Arfgap1Q9EPJ9 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Arfgap1Q9EPJ9 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Arfgap1Q9EPJ9 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Arfgap1Q9EPJ9 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Arfgap1Q9EPJ9 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Arfgap1Q9EPJ9 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Arfgap1Q9EPJ9 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Arfgap1Q9EPJ9 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Arfgap1Q9EPJ9 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Arfgap1Q9EPJ9 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Arfgap1Q9EPJ9 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Arfgap1Q9EPJ9 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Arfgap1Q9EPJ9 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Arfgap1Q9EPJ9 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Arfgap1Q9EPJ9 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Arfgap1Q9EPJ9 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Arfgap1Q9EPJ9 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Arfgap1Q9EPJ9 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Arfgap1Q9EPJ9 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Arfgap1Q9EPJ9 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Arfgap1Q9EPJ9 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Arfgap1Q9EPJ9 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Arfgap1Q9EPJ9 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Arfgap1Q9EPJ9 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Arfgap1Q9EPJ9 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Arfgap1Q9EPJ9 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Arfgap1Q9EPJ9 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Arfgap1Q9EPJ9 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Arfgap1Q9EPJ9 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Arfgap1Q9EPJ9 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Arfgap1Q9EPJ9 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Arfgap1Q9EPJ9 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Arfgap1Q9EPJ9 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Arfgap1Q9EPJ9 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Arfgap1Q9EPJ9 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Arfgap1Q9EPJ9 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Arfgap1Q9EPJ9 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Arfgap1Q9EPJ9 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Arfgap1Q9EPJ9 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Arfgap1Q9EPJ9 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Arfgap1Q9EPJ9 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Arfgap1Q9EPJ9 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Arfgap1Q9EPJ9 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Arfgap1Q9EPJ9 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Arfgap1Q9EPJ9 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Arfgap1Q9EPJ9 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Arfgap1Q9EPJ9 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Arfgap1Q9EPJ9 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Arfgap1Q9EPJ9 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Arfgap1Q9EPJ9 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Arfgap1Q9EPJ9 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Arfgap1Q9EPJ9 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Arfgap1Q9EPJ9 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Arfgap1Q9EPJ9 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Arfgap1Q9EPJ9 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Arfgap1Q9EPJ9 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Arfgap1Q9EPJ9 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Arfgap1Q9EPJ9 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Arfgap1Q9EPJ9 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Arfgap1Q9EPJ9 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Arfgap1Q9EPJ9 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Arfgap1Q9EPJ9 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Arfgap1Q9EPJ9 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Arfgap1Q9EPJ9 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Arfgap1Q9EPJ9 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Arfgap1Q9EPJ9 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Arfgap1Q9EPJ9 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Arfgap1Q9EPJ9 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Arfgap1Q9EPJ9 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Arfgap1Q9EPJ9 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Arfgap1Q9EPJ9 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Arfgap1Q9EPJ9 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Arfgap1Q9EPJ9 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Arfgap1Q9EPJ9 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Arfgap1Q9EPJ9 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Arfgap1Q9EPJ9 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Arfgap1Q9EPJ9 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Arfgap1Q9EPJ9 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Arfgap1Q9EPJ9 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Arfgap1Q9EPJ9 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Arfgap1Q9EPJ9 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Arfgap1Q9EPJ9 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Arfgap1Q9EPJ9 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Arfgap1Q9EPJ9 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Arfgap1Q9EPJ9 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Arfgap1Q9EPJ9 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Arfgap1Q9EPJ9 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Arfgap1Q9EPJ9 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Arfgap1Q9EPJ9 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Arfgap1Q9EPJ9 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Arfgap1Q9EPJ9 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms