Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCT5

Sdf2, Stromal cell-derived factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sdf2Q9DCT5 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sdf2Q9DCT5 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sdf2Q9DCT5 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sdf2Q9DCT5 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sdf2Q9DCT5 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sdf2Q9DCT5 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sdf2Q9DCT5 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sdf2Q9DCT5 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sdf2Q9DCT5 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sdf2Q9DCT5 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sdf2Q9DCT5 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sdf2Q9DCT5 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sdf2Q9DCT5 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sdf2Q9DCT5 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sdf2Q9DCT5 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sdf2Q9DCT5 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sdf2Q9DCT5 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sdf2Q9DCT5 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sdf2Q9DCT5 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sdf2Q9DCT5 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sdf2Q9DCT5 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sdf2Q9DCT5 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sdf2Q9DCT5 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sdf2Q9DCT5 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sdf2Q9DCT5 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sdf2Q9DCT5 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sdf2Q9DCT5 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sdf2Q9DCT5 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sdf2Q9DCT5 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sdf2Q9DCT5 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sdf2Q9DCT5 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sdf2Q9DCT5 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sdf2Q9DCT5 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sdf2Q9DCT5 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sdf2Q9DCT5 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sdf2Q9DCT5 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sdf2Q9DCT5 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sdf2Q9DCT5 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sdf2Q9DCT5 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sdf2Q9DCT5 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sdf2Q9DCT5 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sdf2Q9DCT5 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sdf2Q9DCT5 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sdf2Q9DCT5 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sdf2Q9DCT5 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sdf2Q9DCT5 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sdf2Q9DCT5 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sdf2Q9DCT5 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sdf2Q9DCT5 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sdf2Q9DCT5 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sdf2Q9DCT5 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sdf2Q9DCT5 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Sdf2Q9DCT5 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Sdf2Q9DCT5 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sdf2Q9DCT5 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sdf2Q9DCT5 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sdf2Q9DCT5 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sdf2Q9DCT5 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sdf2Q9DCT5 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sdf2Q9DCT5 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sdf2Q9DCT5 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sdf2Q9DCT5 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sdf2Q9DCT5 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sdf2Q9DCT5 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sdf2Q9DCT5 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Sdf2Q9DCT5 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Sdf2Q9DCT5 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Sdf2Q9DCT5 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Sdf2Q9DCT5 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Sdf2Q9DCT5 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sdf2Q9DCT5 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sdf2Q9DCT5 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Sdf2Q9DCT5 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sdf2Q9DCT5 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sdf2Q9DCT5 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sdf2Q9DCT5 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sdf2Q9DCT5 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sdf2Q9DCT5 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sdf2Q9DCT5 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sdf2Q9DCT5 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sdf2Q9DCT5 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sdf2Q9DCT5 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sdf2Q9DCT5 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sdf2Q9DCT5 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sdf2Q9DCT5 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sdf2Q9DCT5 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sdf2Q9DCT5 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sdf2Q9DCT5 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Sdf2Q9DCT5 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sdf2Q9DCT5 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sdf2Q9DCT5 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sdf2Q9DCT5 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sdf2Q9DCT5 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sdf2Q9DCT5 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sdf2Q9DCT5 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sdf2Q9DCT5 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sdf2Q9DCT5 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sdf2Q9DCT5 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sdf2Q9DCT5 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sdf2Q9DCT5 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms