Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCN7

Rnft1, E3 ubiquitin-protein ligase RNFT1, mousemouse

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnft1Q9DCN7 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rnft1Q9DCN7 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rnft1Q9DCN7 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rnft1Q9DCN7 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rnft1Q9DCN7 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rnft1Q9DCN7 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rnft1Q9DCN7 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Rnft1Q9DCN7 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rnft1Q9DCN7 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Rnft1Q9DCN7 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rnft1Q9DCN7 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rnft1Q9DCN7 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rnft1Q9DCN7 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rnft1Q9DCN7 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rnft1Q9DCN7 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rnft1Q9DCN7 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rnft1Q9DCN7 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Rnft1Q9DCN7 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Rnft1Q9DCN7 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Rnft1Q9DCN7 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Rnft1Q9DCN7 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Rnft1Q9DCN7 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Rnft1Q9DCN7 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Rnft1Q9DCN7 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Rnft1Q9DCN7 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Rnft1Q9DCN7 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Rnft1Q9DCN7 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rnft1Q9DCN7 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Rnft1Q9DCN7 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rnft1Q9DCN7 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rnft1Q9DCN7 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rnft1Q9DCN7 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rnft1Q9DCN7 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rnft1Q9DCN7 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Rnft1Q9DCN7 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rnft1Q9DCN7 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rnft1Q9DCN7 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rnft1Q9DCN7 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rnft1Q9DCN7 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rnft1Q9DCN7 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rnft1Q9DCN7 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rnft1Q9DCN7 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rnft1Q9DCN7 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rnft1Q9DCN7 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rnft1Q9DCN7 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rnft1Q9DCN7 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rnft1Q9DCN7 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rnft1Q9DCN7 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rnft1Q9DCN7 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rnft1Q9DCN7 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rnft1Q9DCN7 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rnft1Q9DCN7 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rnft1Q9DCN7 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rnft1Q9DCN7 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rnft1Q9DCN7 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rnft1Q9DCN7 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rnft1Q9DCN7 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rnft1Q9DCN7 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rnft1Q9DCN7 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rnft1Q9DCN7 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rnft1Q9DCN7 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rnft1Q9DCN7 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Rnft1Q9DCN7 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rnft1Q9DCN7 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rnft1Q9DCN7 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rnft1Q9DCN7 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rnft1Q9DCN7 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rnft1Q9DCN7 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rnft1Q9DCN7 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rnft1Q9DCN7 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rnft1Q9DCN7 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rnft1Q9DCN7 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rnft1Q9DCN7 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rnft1Q9DCN7 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rnft1Q9DCN7 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rnft1Q9DCN7 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Rnft1Q9DCN7 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rnft1Q9DCN7 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rnft1Q9DCN7 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rnft1Q9DCN7 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rnft1Q9DCN7 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rnft1Q9DCN7 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rnft1Q9DCN7 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rnft1Q9DCN7 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rnft1Q9DCN7 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rnft1Q9DCN7 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rnft1Q9DCN7 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rnft1Q9DCN7 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rnft1Q9DCN7 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rnft1Q9DCN7 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rnft1Q9DCN7 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rnft1Q9DCN7 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rnft1Q9DCN7 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rnft1Q9DCN7 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rnft1Q9DCN7 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rnft1Q9DCN7 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rnft1Q9DCN7 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rnft1Q9DCN7 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rnft1Q9DCN7 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rnft1Q9DCN7 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.5 ms