Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCG9

Trmt112, Multifunctional methyltransferase subunit TRM112-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 125 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trmt112Q9DCG9 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Trmt112Q9DCG9 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Trmt112Q9DCG9 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Trmt112Q9DCG9 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Trmt112Q9DCG9 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Trmt112Q9DCG9 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Trmt112Q9DCG9 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Trmt112Q9DCG9 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Trmt112Q9DCG9 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Trmt112Q9DCG9 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Trmt112Q9DCG9 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Trmt112Q9DCG9 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Trmt112Q9DCG9 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Trmt112Q9DCG9 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Trmt112Q9DCG9 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Trmt112Q9DCG9 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Trmt112Q9DCG9 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Trmt112Q9DCG9 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Trmt112Q9DCG9 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Trmt112Q9DCG9 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Trmt112Q9DCG9 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Trmt112Q9DCG9 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Trmt112Q9DCG9 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Trmt112Q9DCG9 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Trmt112Q9DCG9 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Trmt112Q9DCG9 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Trmt112Q9DCG9 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Trmt112Q9DCG9 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Trmt112Q9DCG9 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Trmt112Q9DCG9 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Trmt112Q9DCG9 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Trmt112Q9DCG9 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Trmt112Q9DCG9 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Trmt112Q9DCG9 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Trmt112Q9DCG9 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Trmt112Q9DCG9 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Trmt112Q9DCG9 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Trmt112Q9DCG9 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Trmt112Q9DCG9 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Trmt112Q9DCG9 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Trmt112Q9DCG9 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Trmt112Q9DCG9 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Trmt112Q9DCG9 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Trmt112Q9DCG9 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Trmt112Q9DCG9 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Trmt112Q9DCG9 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Trmt112Q9DCG9 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Trmt112Q9DCG9 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Trmt112Q9DCG9 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Trmt112Q9DCG9 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Trmt112Q9DCG9 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Trmt112Q9DCG9 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Trmt112Q9DCG9 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Trmt112Q9DCG9 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Trmt112Q9DCG9 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Trmt112Q9DCG9 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Trmt112Q9DCG9 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Trmt112Q9DCG9 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Trmt112Q9DCG9 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Trmt112Q9DCG9 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Trmt112Q9DCG9 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Trmt112Q9DCG9 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Trmt112Q9DCG9 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Trmt112Q9DCG9 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Trmt112Q9DCG9 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Trmt112Q9DCG9 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Trmt112Q9DCG9 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Trmt112Q9DCG9 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Trmt112Q9DCG9 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Trmt112Q9DCG9 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Trmt112Q9DCG9 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Trmt112Q9DCG9 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Trmt112Q9DCG9 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Trmt112Q9DCG9 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Trmt112Q9DCG9 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Trmt112Q9DCG9 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Trmt112Q9DCG9 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Trmt112Q9DCG9 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Trmt112Q9DCG9 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Trmt112Q9DCG9 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Trmt112Q9DCG9 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Trmt112Q9DCG9 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Trmt112Q9DCG9 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Trmt112Q9DCG9 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Trmt112Q9DCG9 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Trmt112Q9DCG9 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Trmt112Q9DCG9 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Trmt112Q9DCG9 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Trmt112Q9DCG9 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Trmt112Q9DCG9 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Trmt112Q9DCG9 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Trmt112Q9DCG9 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Trmt112Q9DCG9 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Trmt112Q9DCG9 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Trmt112Q9DCG9 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Trmt112Q9DCG9 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Trmt112Q9DCG9 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Trmt112Q9DCG9 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Trmt112Q9DCG9 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Trmt112Q9DCG9 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.4 ms