Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCD2

Xab2, Pre-mRNA-splicing factor SYF1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 855 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xab2Q9DCD2 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Xab2Q9DCD2 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Xab2Q9DCD2 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Xab2Q9DCD2 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Xab2Q9DCD2 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Xab2Q9DCD2 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Xab2Q9DCD2 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Xab2Q9DCD2 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Xab2Q9DCD2 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Xab2Q9DCD2 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Xab2Q9DCD2 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Xab2Q9DCD2 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Xab2Q9DCD2 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Xab2Q9DCD2 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Xab2Q9DCD2 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Xab2Q9DCD2 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Xab2Q9DCD2 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Xab2Q9DCD2 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Xab2Q9DCD2 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Xab2Q9DCD2 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Xab2Q9DCD2 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Xab2Q9DCD2 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Xab2Q9DCD2 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Xab2Q9DCD2 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Xab2Q9DCD2 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Xab2Q9DCD2 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Xab2Q9DCD2 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Xab2Q9DCD2 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Xab2Q9DCD2 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Xab2Q9DCD2 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Xab2Q9DCD2 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Xab2Q9DCD2 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Xab2Q9DCD2 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Xab2Q9DCD2 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Xab2Q9DCD2 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Xab2Q9DCD2 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Xab2Q9DCD2 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Xab2Q9DCD2 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Xab2Q9DCD2 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Xab2Q9DCD2 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Xab2Q9DCD2 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Xab2Q9DCD2 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Xab2Q9DCD2 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Xab2Q9DCD2 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Xab2Q9DCD2 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Xab2Q9DCD2 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Xab2Q9DCD2 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Xab2Q9DCD2 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Xab2Q9DCD2 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Xab2Q9DCD2 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Xab2Q9DCD2 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Xab2Q9DCD2 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Xab2Q9DCD2 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Xab2Q9DCD2 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Xab2Q9DCD2 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Xab2Q9DCD2 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Xab2Q9DCD2 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Xab2Q9DCD2 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Xab2Q9DCD2 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Xab2Q9DCD2 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Xab2Q9DCD2 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Xab2Q9DCD2 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Xab2Q9DCD2 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Xab2Q9DCD2 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Xab2Q9DCD2 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Xab2Q9DCD2 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Xab2Q9DCD2 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Xab2Q9DCD2 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Xab2Q9DCD2 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Xab2Q9DCD2 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Xab2Q9DCD2 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Xab2Q9DCD2 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Xab2Q9DCD2 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Xab2Q9DCD2 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Xab2Q9DCD2 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Xab2Q9DCD2 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Xab2Q9DCD2 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Xab2Q9DCD2 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Xab2Q9DCD2 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Xab2Q9DCD2 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Xab2Q9DCD2 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Xab2Q9DCD2 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Xab2Q9DCD2 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Xab2Q9DCD2 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Xab2Q9DCD2 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Xab2Q9DCD2 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Xab2Q9DCD2 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Xab2Q9DCD2 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Xab2Q9DCD2 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Xab2Q9DCD2 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Xab2Q9DCD2 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Xab2Q9DCD2 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Xab2Q9DCD2 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Xab2Q9DCD2 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Xab2Q9DCD2 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Xab2Q9DCD2 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Xab2Q9DCD2 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Xab2Q9DCD2 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Xab2Q9DCD2 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Xab2Q9DCD2 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms