Protein–RNA interactions for Protein: Q9DC16

Ergic1, Endoplasmic reticulum-Golgi intermediate compartment protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 290 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ergic1Q9DC16 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ergic1Q9DC16 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ergic1Q9DC16 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ergic1Q9DC16 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ergic1Q9DC16 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ergic1Q9DC16 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ergic1Q9DC16 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ergic1Q9DC16 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ergic1Q9DC16 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ergic1Q9DC16 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ergic1Q9DC16 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ergic1Q9DC16 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ergic1Q9DC16 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ergic1Q9DC16 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ergic1Q9DC16 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ergic1Q9DC16 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ergic1Q9DC16 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ergic1Q9DC16 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ergic1Q9DC16 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ergic1Q9DC16 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ergic1Q9DC16 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ergic1Q9DC16 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ergic1Q9DC16 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ergic1Q9DC16 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ergic1Q9DC16 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ergic1Q9DC16 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ergic1Q9DC16 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ergic1Q9DC16 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Ergic1Q9DC16 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ergic1Q9DC16 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ergic1Q9DC16 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ergic1Q9DC16 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ergic1Q9DC16 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ergic1Q9DC16 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ergic1Q9DC16 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ergic1Q9DC16 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ergic1Q9DC16 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ergic1Q9DC16 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ergic1Q9DC16 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Ergic1Q9DC16 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ergic1Q9DC16 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ergic1Q9DC16 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ergic1Q9DC16 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ergic1Q9DC16 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ergic1Q9DC16 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ergic1Q9DC16 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ergic1Q9DC16 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ergic1Q9DC16 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ergic1Q9DC16 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ergic1Q9DC16 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ergic1Q9DC16 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ergic1Q9DC16 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ergic1Q9DC16 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ergic1Q9DC16 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ergic1Q9DC16 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ergic1Q9DC16 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ergic1Q9DC16 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ergic1Q9DC16 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ergic1Q9DC16 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ergic1Q9DC16 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ergic1Q9DC16 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ergic1Q9DC16 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ergic1Q9DC16 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ergic1Q9DC16 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ergic1Q9DC16 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ergic1Q9DC16 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ergic1Q9DC16 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ergic1Q9DC16 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ergic1Q9DC16 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Ergic1Q9DC16 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Ergic1Q9DC16 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ergic1Q9DC16 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ergic1Q9DC16 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ergic1Q9DC16 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ergic1Q9DC16 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ergic1Q9DC16 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ergic1Q9DC16 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ergic1Q9DC16 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ergic1Q9DC16 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ergic1Q9DC16 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Ergic1Q9DC16 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ergic1Q9DC16 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ergic1Q9DC16 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ergic1Q9DC16 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ergic1Q9DC16 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ergic1Q9DC16 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ergic1Q9DC16 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ergic1Q9DC16 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ergic1Q9DC16 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ergic1Q9DC16 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ergic1Q9DC16 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ergic1Q9DC16 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ergic1Q9DC16 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ergic1Q9DC16 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Ergic1Q9DC16 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ergic1Q9DC16 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ergic1Q9DC16 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ergic1Q9DC16 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ergic1Q9DC16 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ergic1Q9DC16 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms