Protein–RNA interactions for Protein: Q9DAP7

Asf1b, Histone chaperone ASF1B, mousemouse

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Length 202 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Asf1bQ9DAP7 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Asf1bQ9DAP7 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Asf1bQ9DAP7 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Asf1bQ9DAP7 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Asf1bQ9DAP7 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Asf1bQ9DAP7 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Asf1bQ9DAP7 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Asf1bQ9DAP7 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Asf1bQ9DAP7 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Asf1bQ9DAP7 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Asf1bQ9DAP7 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Asf1bQ9DAP7 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Asf1bQ9DAP7 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Asf1bQ9DAP7 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Asf1bQ9DAP7 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Asf1bQ9DAP7 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
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Asf1bQ9DAP7 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Asf1bQ9DAP7 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Asf1bQ9DAP7 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Asf1bQ9DAP7 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Asf1bQ9DAP7 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Asf1bQ9DAP7 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Asf1bQ9DAP7 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Asf1bQ9DAP7 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Asf1bQ9DAP7 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Asf1bQ9DAP7 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Asf1bQ9DAP7 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Asf1bQ9DAP7 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Asf1bQ9DAP7 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Asf1bQ9DAP7 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Asf1bQ9DAP7 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Asf1bQ9DAP7 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Asf1bQ9DAP7 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Asf1bQ9DAP7 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Asf1bQ9DAP7 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Asf1bQ9DAP7 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Asf1bQ9DAP7 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Asf1bQ9DAP7 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Asf1bQ9DAP7 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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Asf1bQ9DAP7 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Asf1bQ9DAP7 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Asf1bQ9DAP7 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Asf1bQ9DAP7 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Asf1bQ9DAP7 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Asf1bQ9DAP7 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Asf1bQ9DAP7 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Asf1bQ9DAP7 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Asf1bQ9DAP7 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Asf1bQ9DAP7 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Asf1bQ9DAP7 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Asf1bQ9DAP7 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Asf1bQ9DAP7 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Asf1bQ9DAP7 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Asf1bQ9DAP7 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Asf1bQ9DAP7 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Asf1bQ9DAP7 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Asf1bQ9DAP7 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Asf1bQ9DAP7 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Asf1bQ9DAP7 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Asf1bQ9DAP7 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Asf1bQ9DAP7 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Asf1bQ9DAP7 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.8 ms