Protein–RNA interactions for Protein: Q9DAK3

Rhobtb1, Rho-related BTB domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 695 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhobtb1Q9DAK3 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rhobtb1Q9DAK3 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rhobtb1Q9DAK3 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rhobtb1Q9DAK3 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Rhobtb1Q9DAK3 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rhobtb1Q9DAK3 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Rhobtb1Q9DAK3 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rhobtb1Q9DAK3 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rhobtb1Q9DAK3 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rhobtb1Q9DAK3 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rhobtb1Q9DAK3 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rhobtb1Q9DAK3 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rhobtb1Q9DAK3 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Rhobtb1Q9DAK3 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rhobtb1Q9DAK3 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rhobtb1Q9DAK3 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rhobtb1Q9DAK3 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rhobtb1Q9DAK3 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rhobtb1Q9DAK3 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rhobtb1Q9DAK3 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rhobtb1Q9DAK3 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Rhobtb1Q9DAK3 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Rhobtb1Q9DAK3 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rhobtb1Q9DAK3 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rhobtb1Q9DAK3 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rhobtb1Q9DAK3 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rhobtb1Q9DAK3 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rhobtb1Q9DAK3 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rhobtb1Q9DAK3 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rhobtb1Q9DAK3 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rhobtb1Q9DAK3 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rhobtb1Q9DAK3 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rhobtb1Q9DAK3 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rhobtb1Q9DAK3 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rhobtb1Q9DAK3 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rhobtb1Q9DAK3 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rhobtb1Q9DAK3 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rhobtb1Q9DAK3 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rhobtb1Q9DAK3 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rhobtb1Q9DAK3 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rhobtb1Q9DAK3 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rhobtb1Q9DAK3 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rhobtb1Q9DAK3 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rhobtb1Q9DAK3 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rhobtb1Q9DAK3 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rhobtb1Q9DAK3 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Rhobtb1Q9DAK3 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rhobtb1Q9DAK3 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Rhobtb1Q9DAK3 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rhobtb1Q9DAK3 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rhobtb1Q9DAK3 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rhobtb1Q9DAK3 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rhobtb1Q9DAK3 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rhobtb1Q9DAK3 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rhobtb1Q9DAK3 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rhobtb1Q9DAK3 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rhobtb1Q9DAK3 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rhobtb1Q9DAK3 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rhobtb1Q9DAK3 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rhobtb1Q9DAK3 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rhobtb1Q9DAK3 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rhobtb1Q9DAK3 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rhobtb1Q9DAK3 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rhobtb1Q9DAK3 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rhobtb1Q9DAK3 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rhobtb1Q9DAK3 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rhobtb1Q9DAK3 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rhobtb1Q9DAK3 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rhobtb1Q9DAK3 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rhobtb1Q9DAK3 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rhobtb1Q9DAK3 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Rhobtb1Q9DAK3 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rhobtb1Q9DAK3 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rhobtb1Q9DAK3 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rhobtb1Q9DAK3 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rhobtb1Q9DAK3 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rhobtb1Q9DAK3 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rhobtb1Q9DAK3 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Rhobtb1Q9DAK3 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rhobtb1Q9DAK3 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rhobtb1Q9DAK3 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rhobtb1Q9DAK3 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rhobtb1Q9DAK3 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rhobtb1Q9DAK3 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Rhobtb1Q9DAK3 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Rhobtb1Q9DAK3 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rhobtb1Q9DAK3 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rhobtb1Q9DAK3 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rhobtb1Q9DAK3 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rhobtb1Q9DAK3 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rhobtb1Q9DAK3 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rhobtb1Q9DAK3 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rhobtb1Q9DAK3 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rhobtb1Q9DAK3 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rhobtb1Q9DAK3 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rhobtb1Q9DAK3 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rhobtb1Q9DAK3 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rhobtb1Q9DAK3 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rhobtb1Q9DAK3 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rhobtb1Q9DAK3 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.8 ms