Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA37

Samd8, Sphingomyelin synthase-related protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 478 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samd8Q9DA37 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Samd8Q9DA37 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Samd8Q9DA37 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Samd8Q9DA37 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Samd8Q9DA37 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Samd8Q9DA37 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Samd8Q9DA37 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Samd8Q9DA37 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Samd8Q9DA37 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Samd8Q9DA37 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Samd8Q9DA37 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Samd8Q9DA37 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Samd8Q9DA37 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Samd8Q9DA37 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Samd8Q9DA37 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Samd8Q9DA37 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Samd8Q9DA37 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Samd8Q9DA37 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Samd8Q9DA37 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Samd8Q9DA37 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Samd8Q9DA37 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Samd8Q9DA37 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Samd8Q9DA37 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Samd8Q9DA37 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Samd8Q9DA37 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Samd8Q9DA37 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Samd8Q9DA37 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Samd8Q9DA37 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Samd8Q9DA37 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Samd8Q9DA37 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Samd8Q9DA37 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Samd8Q9DA37 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Samd8Q9DA37 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Samd8Q9DA37 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Samd8Q9DA37 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Samd8Q9DA37 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Samd8Q9DA37 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Samd8Q9DA37 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Samd8Q9DA37 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Samd8Q9DA37 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Samd8Q9DA37 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Samd8Q9DA37 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Samd8Q9DA37 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Samd8Q9DA37 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Samd8Q9DA37 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Samd8Q9DA37 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Samd8Q9DA37 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Samd8Q9DA37 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Samd8Q9DA37 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Samd8Q9DA37 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Samd8Q9DA37 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Samd8Q9DA37 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Samd8Q9DA37 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Samd8Q9DA37 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Samd8Q9DA37 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Samd8Q9DA37 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Samd8Q9DA37 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Samd8Q9DA37 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Samd8Q9DA37 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Samd8Q9DA37 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Samd8Q9DA37 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Samd8Q9DA37 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Samd8Q9DA37 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Samd8Q9DA37 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Samd8Q9DA37 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Samd8Q9DA37 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Samd8Q9DA37 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Samd8Q9DA37 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Samd8Q9DA37 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Samd8Q9DA37 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Samd8Q9DA37 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Samd8Q9DA37 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Samd8Q9DA37 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Samd8Q9DA37 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Samd8Q9DA37 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Samd8Q9DA37 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
Samd8Q9DA37 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Samd8Q9DA37 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Samd8Q9DA37 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Samd8Q9DA37 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Samd8Q9DA37 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Samd8Q9DA37 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Samd8Q9DA37 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Samd8Q9DA37 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Samd8Q9DA37 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Samd8Q9DA37 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Samd8Q9DA37 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Samd8Q9DA37 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Samd8Q9DA37 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Samd8Q9DA37 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Samd8Q9DA37 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Samd8Q9DA37 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Samd8Q9DA37 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Samd8Q9DA37 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Samd8Q9DA37 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Samd8Q9DA37 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Samd8Q9DA37 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Samd8Q9DA37 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Samd8Q9DA37 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Samd8Q9DA37 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms