Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9Y7

1700025F22Rik, RIKEN cDNA 1700025F22, mousemouse

Predictions only

Length 111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700025F22RikQ9D9Y7 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
1700025F22RikQ9D9Y7 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
1700025F22RikQ9D9Y7 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
1700025F22RikQ9D9Y7 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
1700025F22RikQ9D9Y7 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
1700025F22RikQ9D9Y7 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
1700025F22RikQ9D9Y7 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
1700025F22RikQ9D9Y7 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
1700025F22RikQ9D9Y7 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
1700025F22RikQ9D9Y7 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
1700025F22RikQ9D9Y7 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
1700025F22RikQ9D9Y7 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
1700025F22RikQ9D9Y7 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
1700025F22RikQ9D9Y7 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
1700025F22RikQ9D9Y7 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
1700025F22RikQ9D9Y7 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
1700025F22RikQ9D9Y7 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
1700025F22RikQ9D9Y7 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
1700025F22RikQ9D9Y7 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
1700025F22RikQ9D9Y7 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
1700025F22RikQ9D9Y7 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
1700025F22RikQ9D9Y7 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
1700025F22RikQ9D9Y7 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
1700025F22RikQ9D9Y7 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
1700025F22RikQ9D9Y7 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
1700025F22RikQ9D9Y7 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
1700025F22RikQ9D9Y7 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
1700025F22RikQ9D9Y7 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
1700025F22RikQ9D9Y7 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
1700025F22RikQ9D9Y7 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
1700025F22RikQ9D9Y7 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
1700025F22RikQ9D9Y7 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
1700025F22RikQ9D9Y7 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
1700025F22RikQ9D9Y7 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
1700025F22RikQ9D9Y7 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
1700025F22RikQ9D9Y7 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
1700025F22RikQ9D9Y7 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
1700025F22RikQ9D9Y7 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
1700025F22RikQ9D9Y7 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
1700025F22RikQ9D9Y7 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
1700025F22RikQ9D9Y7 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
1700025F22RikQ9D9Y7 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
1700025F22RikQ9D9Y7 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
1700025F22RikQ9D9Y7 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
1700025F22RikQ9D9Y7 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
1700025F22RikQ9D9Y7 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
1700025F22RikQ9D9Y7 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
1700025F22RikQ9D9Y7 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
1700025F22RikQ9D9Y7 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
1700025F22RikQ9D9Y7 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
1700025F22RikQ9D9Y7 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
1700025F22RikQ9D9Y7 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
1700025F22RikQ9D9Y7 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
1700025F22RikQ9D9Y7 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
1700025F22RikQ9D9Y7 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
1700025F22RikQ9D9Y7 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
1700025F22RikQ9D9Y7 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
1700025F22RikQ9D9Y7 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
1700025F22RikQ9D9Y7 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
1700025F22RikQ9D9Y7 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
1700025F22RikQ9D9Y7 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
1700025F22RikQ9D9Y7 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
1700025F22RikQ9D9Y7 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
1700025F22RikQ9D9Y7 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
1700025F22RikQ9D9Y7 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
1700025F22RikQ9D9Y7 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
1700025F22RikQ9D9Y7 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
1700025F22RikQ9D9Y7 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
1700025F22RikQ9D9Y7 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
1700025F22RikQ9D9Y7 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
1700025F22RikQ9D9Y7 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
1700025F22RikQ9D9Y7 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
1700025F22RikQ9D9Y7 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
1700025F22RikQ9D9Y7 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
1700025F22RikQ9D9Y7 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
1700025F22RikQ9D9Y7 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
1700025F22RikQ9D9Y7 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
1700025F22RikQ9D9Y7 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
1700025F22RikQ9D9Y7 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
1700025F22RikQ9D9Y7 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
1700025F22RikQ9D9Y7 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
1700025F22RikQ9D9Y7 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
1700025F22RikQ9D9Y7 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
1700025F22RikQ9D9Y7 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
1700025F22RikQ9D9Y7 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
1700025F22RikQ9D9Y7 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
1700025F22RikQ9D9Y7 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
1700025F22RikQ9D9Y7 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
1700025F22RikQ9D9Y7 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
1700025F22RikQ9D9Y7 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
1700025F22RikQ9D9Y7 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
1700025F22RikQ9D9Y7 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
1700025F22RikQ9D9Y7 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
1700025F22RikQ9D9Y7 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
1700025F22RikQ9D9Y7 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
1700025F22RikQ9D9Y7 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
1700025F22RikQ9D9Y7 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
1700025F22RikQ9D9Y7 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
1700025F22RikQ9D9Y7 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
1700025F22RikQ9D9Y7 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms