Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9P2

Ccdc103, Coiled-coil domain-containing protein 103, mousemouse

Predictions only

Length 237 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc103Q9D9P2 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc103Q9D9P2 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc103Q9D9P2 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc103Q9D9P2 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc103Q9D9P2 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc103Q9D9P2 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc103Q9D9P2 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc103Q9D9P2 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc103Q9D9P2 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc103Q9D9P2 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc103Q9D9P2 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc103Q9D9P2 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc103Q9D9P2 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc103Q9D9P2 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc103Q9D9P2 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc103Q9D9P2 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc103Q9D9P2 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc103Q9D9P2 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc103Q9D9P2 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc103Q9D9P2 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc103Q9D9P2 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc103Q9D9P2 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc103Q9D9P2 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc103Q9D9P2 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ccdc103Q9D9P2 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ccdc103Q9D9P2 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ccdc103Q9D9P2 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ccdc103Q9D9P2 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ccdc103Q9D9P2 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ccdc103Q9D9P2 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ccdc103Q9D9P2 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ccdc103Q9D9P2 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ccdc103Q9D9P2 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc103Q9D9P2 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc103Q9D9P2 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc103Q9D9P2 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc103Q9D9P2 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc103Q9D9P2 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc103Q9D9P2 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc103Q9D9P2 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc103Q9D9P2 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc103Q9D9P2 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc103Q9D9P2 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc103Q9D9P2 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc103Q9D9P2 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc103Q9D9P2 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc103Q9D9P2 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc103Q9D9P2 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc103Q9D9P2 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc103Q9D9P2 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc103Q9D9P2 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc103Q9D9P2 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc103Q9D9P2 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc103Q9D9P2 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc103Q9D9P2 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc103Q9D9P2 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc103Q9D9P2 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc103Q9D9P2 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc103Q9D9P2 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc103Q9D9P2 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc103Q9D9P2 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc103Q9D9P2 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc103Q9D9P2 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc103Q9D9P2 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc103Q9D9P2 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc103Q9D9P2 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc103Q9D9P2 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc103Q9D9P2 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc103Q9D9P2 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc103Q9D9P2 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc103Q9D9P2 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc103Q9D9P2 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc103Q9D9P2 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc103Q9D9P2 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc103Q9D9P2 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc103Q9D9P2 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc103Q9D9P2 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc103Q9D9P2 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc103Q9D9P2 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc103Q9D9P2 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc103Q9D9P2 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc103Q9D9P2 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc103Q9D9P2 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc103Q9D9P2 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc103Q9D9P2 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc103Q9D9P2 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc103Q9D9P2 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc103Q9D9P2 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc103Q9D9P2 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc103Q9D9P2 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc103Q9D9P2 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc103Q9D9P2 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc103Q9D9P2 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc103Q9D9P2 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc103Q9D9P2 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc103Q9D9P2 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc103Q9D9P2 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc103Q9D9P2 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc103Q9D9P2 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc103Q9D9P2 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms