Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9M2

Usp12, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 12, mousemouse

Predictions only

Length 370 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp12Q9D9M2 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Usp12Q9D9M2 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Usp12Q9D9M2 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Usp12Q9D9M2 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Usp12Q9D9M2 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Usp12Q9D9M2 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Usp12Q9D9M2 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Usp12Q9D9M2 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Usp12Q9D9M2 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Usp12Q9D9M2 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Usp12Q9D9M2 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Usp12Q9D9M2 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Usp12Q9D9M2 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Usp12Q9D9M2 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
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Usp12Q9D9M2 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
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Usp12Q9D9M2 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Usp12Q9D9M2 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Usp12Q9D9M2 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Usp12Q9D9M2 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Usp12Q9D9M2 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Usp12Q9D9M2 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Usp12Q9D9M2 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Usp12Q9D9M2 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Usp12Q9D9M2 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Usp12Q9D9M2 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Usp12Q9D9M2 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Usp12Q9D9M2 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Usp12Q9D9M2 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Usp12Q9D9M2 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
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Usp12Q9D9M2 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Usp12Q9D9M2 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Usp12Q9D9M2 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Usp12Q9D9M2 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Usp12Q9D9M2 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Usp12Q9D9M2 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Usp12Q9D9M2 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Usp12Q9D9M2 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Usp12Q9D9M2 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
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Usp12Q9D9M2 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Usp12Q9D9M2 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Usp12Q9D9M2 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Usp12Q9D9M2 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Usp12Q9D9M2 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Usp12Q9D9M2 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Usp12Q9D9M2 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Usp12Q9D9M2 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Usp12Q9D9M2 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Usp12Q9D9M2 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
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Usp12Q9D9M2 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Usp12Q9D9M2 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Usp12Q9D9M2 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Usp12Q9D9M2 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Usp12Q9D9M2 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Usp12Q9D9M2 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Usp12Q9D9M2 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Usp12Q9D9M2 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
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Usp12Q9D9M2 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Usp12Q9D9M2 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Usp12Q9D9M2 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Usp12Q9D9M2 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Usp12Q9D9M2 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Usp12Q9D9M2 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Usp12Q9D9M2 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
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Usp12Q9D9M2 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Usp12Q9D9M2 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Usp12Q9D9M2 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Usp12Q9D9M2 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Usp12Q9D9M2 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Usp12Q9D9M2 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Usp12Q9D9M2 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Usp12Q9D9M2 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Usp12Q9D9M2 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Usp12Q9D9M2 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Usp12Q9D9M2 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Usp12Q9D9M2 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Usp12Q9D9M2 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Usp12Q9D9M2 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Usp12Q9D9M2 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Usp12Q9D9M2 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Usp12Q9D9M2 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Usp12Q9D9M2 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Usp12Q9D9M2 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Usp12Q9D9M2 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Usp12Q9D9M2 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Usp12Q9D9M2 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
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