Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8T4

Tvp23b, Golgi apparatus membrane protein TVP23 homolog B, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tvp23bQ9D8T4 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Tvp23bQ9D8T4 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tvp23bQ9D8T4 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tvp23bQ9D8T4 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tvp23bQ9D8T4 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tvp23bQ9D8T4 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tvp23bQ9D8T4 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tvp23bQ9D8T4 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tvp23bQ9D8T4 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Tvp23bQ9D8T4 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tvp23bQ9D8T4 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tvp23bQ9D8T4 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tvp23bQ9D8T4 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tvp23bQ9D8T4 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tvp23bQ9D8T4 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Tvp23bQ9D8T4 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tvp23bQ9D8T4 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tvp23bQ9D8T4 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tvp23bQ9D8T4 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tvp23bQ9D8T4 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tvp23bQ9D8T4 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tvp23bQ9D8T4 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tvp23bQ9D8T4 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Tvp23bQ9D8T4 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tvp23bQ9D8T4 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tvp23bQ9D8T4 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tvp23bQ9D8T4 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tvp23bQ9D8T4 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tvp23bQ9D8T4 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tvp23bQ9D8T4 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tvp23bQ9D8T4 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tvp23bQ9D8T4 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tvp23bQ9D8T4 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tvp23bQ9D8T4 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tvp23bQ9D8T4 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tvp23bQ9D8T4 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tvp23bQ9D8T4 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tvp23bQ9D8T4 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tvp23bQ9D8T4 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tvp23bQ9D8T4 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tvp23bQ9D8T4 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tvp23bQ9D8T4 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Tvp23bQ9D8T4 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Tvp23bQ9D8T4 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Tvp23bQ9D8T4 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Tvp23bQ9D8T4 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tvp23bQ9D8T4 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tvp23bQ9D8T4 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Tvp23bQ9D8T4 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tvp23bQ9D8T4 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tvp23bQ9D8T4 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tvp23bQ9D8T4 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tvp23bQ9D8T4 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tvp23bQ9D8T4 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tvp23bQ9D8T4 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tvp23bQ9D8T4 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tvp23bQ9D8T4 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tvp23bQ9D8T4 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tvp23bQ9D8T4 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tvp23bQ9D8T4 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tvp23bQ9D8T4 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tvp23bQ9D8T4 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tvp23bQ9D8T4 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tvp23bQ9D8T4 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tvp23bQ9D8T4 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tvp23bQ9D8T4 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tvp23bQ9D8T4 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tvp23bQ9D8T4 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tvp23bQ9D8T4 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tvp23bQ9D8T4 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tvp23bQ9D8T4 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tvp23bQ9D8T4 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tvp23bQ9D8T4 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tvp23bQ9D8T4 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tvp23bQ9D8T4 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tvp23bQ9D8T4 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tvp23bQ9D8T4 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tvp23bQ9D8T4 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tvp23bQ9D8T4 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tvp23bQ9D8T4 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tvp23bQ9D8T4 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tvp23bQ9D8T4 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tvp23bQ9D8T4 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tvp23bQ9D8T4 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tvp23bQ9D8T4 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tvp23bQ9D8T4 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tvp23bQ9D8T4 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tvp23bQ9D8T4 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tvp23bQ9D8T4 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tvp23bQ9D8T4 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tvp23bQ9D8T4 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tvp23bQ9D8T4 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tvp23bQ9D8T4 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tvp23bQ9D8T4 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tvp23bQ9D8T4 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tvp23bQ9D8T4 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tvp23bQ9D8T4 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tvp23bQ9D8T4 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tvp23bQ9D8T4 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tvp23bQ9D8T4 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms