Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8S4

Rexo2, Oligoribonuclease, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 237 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rexo2Q9D8S4 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rexo2Q9D8S4 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rexo2Q9D8S4 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rexo2Q9D8S4 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rexo2Q9D8S4 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rexo2Q9D8S4 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rexo2Q9D8S4 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rexo2Q9D8S4 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rexo2Q9D8S4 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rexo2Q9D8S4 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rexo2Q9D8S4 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rexo2Q9D8S4 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rexo2Q9D8S4 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rexo2Q9D8S4 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rexo2Q9D8S4 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rexo2Q9D8S4 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rexo2Q9D8S4 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rexo2Q9D8S4 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rexo2Q9D8S4 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rexo2Q9D8S4 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rexo2Q9D8S4 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rexo2Q9D8S4 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rexo2Q9D8S4 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Rexo2Q9D8S4 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rexo2Q9D8S4 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rexo2Q9D8S4 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rexo2Q9D8S4 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rexo2Q9D8S4 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rexo2Q9D8S4 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rexo2Q9D8S4 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rexo2Q9D8S4 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rexo2Q9D8S4 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rexo2Q9D8S4 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rexo2Q9D8S4 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rexo2Q9D8S4 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rexo2Q9D8S4 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rexo2Q9D8S4 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rexo2Q9D8S4 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rexo2Q9D8S4 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rexo2Q9D8S4 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rexo2Q9D8S4 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rexo2Q9D8S4 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rexo2Q9D8S4 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rexo2Q9D8S4 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rexo2Q9D8S4 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rexo2Q9D8S4 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rexo2Q9D8S4 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rexo2Q9D8S4 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rexo2Q9D8S4 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rexo2Q9D8S4 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rexo2Q9D8S4 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rexo2Q9D8S4 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rexo2Q9D8S4 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rexo2Q9D8S4 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rexo2Q9D8S4 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Rexo2Q9D8S4 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Rexo2Q9D8S4 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Rexo2Q9D8S4 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Rexo2Q9D8S4 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Rexo2Q9D8S4 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rexo2Q9D8S4 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Rexo2Q9D8S4 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rexo2Q9D8S4 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rexo2Q9D8S4 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rexo2Q9D8S4 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rexo2Q9D8S4 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rexo2Q9D8S4 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rexo2Q9D8S4 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rexo2Q9D8S4 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rexo2Q9D8S4 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rexo2Q9D8S4 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rexo2Q9D8S4 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rexo2Q9D8S4 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rexo2Q9D8S4 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rexo2Q9D8S4 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Rexo2Q9D8S4 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Rexo2Q9D8S4 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rexo2Q9D8S4 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Rexo2Q9D8S4 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rexo2Q9D8S4 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rexo2Q9D8S4 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rexo2Q9D8S4 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rexo2Q9D8S4 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rexo2Q9D8S4 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rexo2Q9D8S4 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rexo2Q9D8S4 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Rexo2Q9D8S4 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rexo2Q9D8S4 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rexo2Q9D8S4 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rexo2Q9D8S4 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rexo2Q9D8S4 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rexo2Q9D8S4 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rexo2Q9D8S4 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rexo2Q9D8S4 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rexo2Q9D8S4 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rexo2Q9D8S4 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rexo2Q9D8S4 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rexo2Q9D8S4 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rexo2Q9D8S4 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rexo2Q9D8S4 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.6 ms