Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8S3

Arfgap3, ADP-ribosylation factor GTPase-activating protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 523 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arfgap3Q9D8S3 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Arfgap3Q9D8S3 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Arfgap3Q9D8S3 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Arfgap3Q9D8S3 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Arfgap3Q9D8S3 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Arfgap3Q9D8S3 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Arfgap3Q9D8S3 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Arfgap3Q9D8S3 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Arfgap3Q9D8S3 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Arfgap3Q9D8S3 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Arfgap3Q9D8S3 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Arfgap3Q9D8S3 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Arfgap3Q9D8S3 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Arfgap3Q9D8S3 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Arfgap3Q9D8S3 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Arfgap3Q9D8S3 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Arfgap3Q9D8S3 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Arfgap3Q9D8S3 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Arfgap3Q9D8S3 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Arfgap3Q9D8S3 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Arfgap3Q9D8S3 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Arfgap3Q9D8S3 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Arfgap3Q9D8S3 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Arfgap3Q9D8S3 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Arfgap3Q9D8S3 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Arfgap3Q9D8S3 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Arfgap3Q9D8S3 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Arfgap3Q9D8S3 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Arfgap3Q9D8S3 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Arfgap3Q9D8S3 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Arfgap3Q9D8S3 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Arfgap3Q9D8S3 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Arfgap3Q9D8S3 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Arfgap3Q9D8S3 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Arfgap3Q9D8S3 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Arfgap3Q9D8S3 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Arfgap3Q9D8S3 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Arfgap3Q9D8S3 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Arfgap3Q9D8S3 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Arfgap3Q9D8S3 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Arfgap3Q9D8S3 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Arfgap3Q9D8S3 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Arfgap3Q9D8S3 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Arfgap3Q9D8S3 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Arfgap3Q9D8S3 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Arfgap3Q9D8S3 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Arfgap3Q9D8S3 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Arfgap3Q9D8S3 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Arfgap3Q9D8S3 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Arfgap3Q9D8S3 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Arfgap3Q9D8S3 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Arfgap3Q9D8S3 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Arfgap3Q9D8S3 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Arfgap3Q9D8S3 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Arfgap3Q9D8S3 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Arfgap3Q9D8S3 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Arfgap3Q9D8S3 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Arfgap3Q9D8S3 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Arfgap3Q9D8S3 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Arfgap3Q9D8S3 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Arfgap3Q9D8S3 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Arfgap3Q9D8S3 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Arfgap3Q9D8S3 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Arfgap3Q9D8S3 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Arfgap3Q9D8S3 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Arfgap3Q9D8S3 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Arfgap3Q9D8S3 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Arfgap3Q9D8S3 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Arfgap3Q9D8S3 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Arfgap3Q9D8S3 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Arfgap3Q9D8S3 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Arfgap3Q9D8S3 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Arfgap3Q9D8S3 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Arfgap3Q9D8S3 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Arfgap3Q9D8S3 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Arfgap3Q9D8S3 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Arfgap3Q9D8S3 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Arfgap3Q9D8S3 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Arfgap3Q9D8S3 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Arfgap3Q9D8S3 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Arfgap3Q9D8S3 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Arfgap3Q9D8S3 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Arfgap3Q9D8S3 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Arfgap3Q9D8S3 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Arfgap3Q9D8S3 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Arfgap3Q9D8S3 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Arfgap3Q9D8S3 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Arfgap3Q9D8S3 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Arfgap3Q9D8S3 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Arfgap3Q9D8S3 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Arfgap3Q9D8S3 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Arfgap3Q9D8S3 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Arfgap3Q9D8S3 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Arfgap3Q9D8S3 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Arfgap3Q9D8S3 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Arfgap3Q9D8S3 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Arfgap3Q9D8S3 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Arfgap3Q9D8S3 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Arfgap3Q9D8S3 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Arfgap3Q9D8S3 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms