Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8C6

Med11, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 11, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Med11Q9D8C6 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Med11Q9D8C6 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Med11Q9D8C6 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Med11Q9D8C6 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Med11Q9D8C6 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Med11Q9D8C6 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Med11Q9D8C6 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Med11Q9D8C6 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Med11Q9D8C6 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Med11Q9D8C6 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Med11Q9D8C6 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Med11Q9D8C6 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Med11Q9D8C6 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Med11Q9D8C6 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Med11Q9D8C6 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Med11Q9D8C6 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Med11Q9D8C6 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Med11Q9D8C6 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Med11Q9D8C6 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Med11Q9D8C6 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Med11Q9D8C6 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Med11Q9D8C6 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Med11Q9D8C6 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Med11Q9D8C6 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Med11Q9D8C6 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Med11Q9D8C6 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Med11Q9D8C6 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Med11Q9D8C6 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Med11Q9D8C6 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Med11Q9D8C6 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Med11Q9D8C6 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Med11Q9D8C6 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Med11Q9D8C6 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Med11Q9D8C6 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Med11Q9D8C6 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Med11Q9D8C6 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Med11Q9D8C6 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Med11Q9D8C6 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Med11Q9D8C6 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Med11Q9D8C6 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Med11Q9D8C6 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Med11Q9D8C6 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Med11Q9D8C6 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Med11Q9D8C6 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Med11Q9D8C6 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Med11Q9D8C6 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Med11Q9D8C6 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Med11Q9D8C6 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Med11Q9D8C6 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Med11Q9D8C6 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Med11Q9D8C6 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Med11Q9D8C6 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Med11Q9D8C6 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Med11Q9D8C6 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Med11Q9D8C6 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Med11Q9D8C6 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Med11Q9D8C6 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Med11Q9D8C6 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Med11Q9D8C6 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Med11Q9D8C6 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Med11Q9D8C6 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Med11Q9D8C6 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Med11Q9D8C6 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Med11Q9D8C6 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Med11Q9D8C6 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Med11Q9D8C6 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Med11Q9D8C6 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Med11Q9D8C6 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Med11Q9D8C6 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Med11Q9D8C6 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Med11Q9D8C6 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Med11Q9D8C6 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Med11Q9D8C6 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Med11Q9D8C6 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Med11Q9D8C6 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Med11Q9D8C6 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Med11Q9D8C6 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Med11Q9D8C6 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Med11Q9D8C6 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Med11Q9D8C6 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Med11Q9D8C6 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Med11Q9D8C6 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Med11Q9D8C6 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Med11Q9D8C6 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Med11Q9D8C6 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Med11Q9D8C6 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Med11Q9D8C6 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Med11Q9D8C6 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Med11Q9D8C6 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Med11Q9D8C6 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Med11Q9D8C6 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Med11Q9D8C6 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Med11Q9D8C6 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Med11Q9D8C6 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Med11Q9D8C6 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Med11Q9D8C6 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Med11Q9D8C6 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Med11Q9D8C6 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Med11Q9D8C6 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Med11Q9D8C6 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms