Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6F4

Gabra4, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabra4Q9D6F4 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gabra4Q9D6F4 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gabra4Q9D6F4 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gabra4Q9D6F4 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gabra4Q9D6F4 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gabra4Q9D6F4 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gabra4Q9D6F4 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gabra4Q9D6F4 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gabra4Q9D6F4 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gabra4Q9D6F4 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gabra4Q9D6F4 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gabra4Q9D6F4 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gabra4Q9D6F4 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gabra4Q9D6F4 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Gabra4Q9D6F4 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Gabra4Q9D6F4 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gabra4Q9D6F4 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gabra4Q9D6F4 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gabra4Q9D6F4 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gabra4Q9D6F4 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gabra4Q9D6F4 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gabra4Q9D6F4 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gabra4Q9D6F4 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gabra4Q9D6F4 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gabra4Q9D6F4 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gabra4Q9D6F4 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gabra4Q9D6F4 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gabra4Q9D6F4 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gabra4Q9D6F4 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gabra4Q9D6F4 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gabra4Q9D6F4 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gabra4Q9D6F4 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gabra4Q9D6F4 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gabra4Q9D6F4 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gabra4Q9D6F4 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gabra4Q9D6F4 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gabra4Q9D6F4 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gabra4Q9D6F4 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gabra4Q9D6F4 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Gabra4Q9D6F4 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gabra4Q9D6F4 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gabra4Q9D6F4 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gabra4Q9D6F4 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gabra4Q9D6F4 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gabra4Q9D6F4 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gabra4Q9D6F4 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gabra4Q9D6F4 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gabra4Q9D6F4 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gabra4Q9D6F4 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gabra4Q9D6F4 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gabra4Q9D6F4 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gabra4Q9D6F4 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gabra4Q9D6F4 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gabra4Q9D6F4 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gabra4Q9D6F4 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gabra4Q9D6F4 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gabra4Q9D6F4 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gabra4Q9D6F4 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gabra4Q9D6F4 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gabra4Q9D6F4 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gabra4Q9D6F4 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gabra4Q9D6F4 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gabra4Q9D6F4 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gabra4Q9D6F4 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gabra4Q9D6F4 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gabra4Q9D6F4 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gabra4Q9D6F4 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gabra4Q9D6F4 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gabra4Q9D6F4 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gabra4Q9D6F4 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gabra4Q9D6F4 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gabra4Q9D6F4 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gabra4Q9D6F4 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gabra4Q9D6F4 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gabra4Q9D6F4 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gabra4Q9D6F4 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Gabra4Q9D6F4 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gabra4Q9D6F4 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gabra4Q9D6F4 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gabra4Q9D6F4 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gabra4Q9D6F4 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gabra4Q9D6F4 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gabra4Q9D6F4 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gabra4Q9D6F4 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Gabra4Q9D6F4 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gabra4Q9D6F4 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Gabra4Q9D6F4 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gabra4Q9D6F4 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gabra4Q9D6F4 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Gabra4Q9D6F4 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Gabra4Q9D6F4 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Gabra4Q9D6F4 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gabra4Q9D6F4 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gabra4Q9D6F4 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Gabra4Q9D6F4 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gabra4Q9D6F4 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Gabra4Q9D6F4 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Gabra4Q9D6F4 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gabra4Q9D6F4 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gabra4Q9D6F4 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.7 ms