Protein–RNA interactions for Protein: Q9D516

Ccdc130, Coiled-coil domain-containing protein 130, mousemouse

Predictions only

Length 385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc130Q9D516 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc130Q9D516 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc130Q9D516 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc130Q9D516 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc130Q9D516 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc130Q9D516 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc130Q9D516 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc130Q9D516 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc130Q9D516 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc130Q9D516 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc130Q9D516 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc130Q9D516 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc130Q9D516 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc130Q9D516 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc130Q9D516 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc130Q9D516 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc130Q9D516 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc130Q9D516 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc130Q9D516 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc130Q9D516 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc130Q9D516 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc130Q9D516 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc130Q9D516 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc130Q9D516 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc130Q9D516 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc130Q9D516 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc130Q9D516 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc130Q9D516 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc130Q9D516 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc130Q9D516 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc130Q9D516 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc130Q9D516 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc130Q9D516 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc130Q9D516 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc130Q9D516 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc130Q9D516 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc130Q9D516 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc130Q9D516 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc130Q9D516 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc130Q9D516 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc130Q9D516 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc130Q9D516 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc130Q9D516 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc130Q9D516 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc130Q9D516 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc130Q9D516 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc130Q9D516 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc130Q9D516 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc130Q9D516 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc130Q9D516 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc130Q9D516 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc130Q9D516 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc130Q9D516 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc130Q9D516 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc130Q9D516 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc130Q9D516 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc130Q9D516 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc130Q9D516 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc130Q9D516 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc130Q9D516 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc130Q9D516 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc130Q9D516 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc130Q9D516 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc130Q9D516 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc130Q9D516 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc130Q9D516 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc130Q9D516 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc130Q9D516 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc130Q9D516 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc130Q9D516 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc130Q9D516 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc130Q9D516 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc130Q9D516 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc130Q9D516 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc130Q9D516 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc130Q9D516 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc130Q9D516 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc130Q9D516 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc130Q9D516 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc130Q9D516 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Ccdc130Q9D516 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc130Q9D516 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc130Q9D516 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc130Q9D516 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc130Q9D516 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc130Q9D516 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc130Q9D516 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc130Q9D516 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc130Q9D516 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc130Q9D516 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc130Q9D516 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc130Q9D516 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc130Q9D516 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc130Q9D516 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc130Q9D516 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc130Q9D516 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc130Q9D516 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc130Q9D516 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc130Q9D516 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc130Q9D516 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.6 ms