Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4V3

Ccdc83, Coiled-coil domain-containing protein 83, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc83Q9D4V3 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc83Q9D4V3 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc83Q9D4V3 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc83Q9D4V3 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc83Q9D4V3 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc83Q9D4V3 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc83Q9D4V3 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc83Q9D4V3 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc83Q9D4V3 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc83Q9D4V3 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc83Q9D4V3 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc83Q9D4V3 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc83Q9D4V3 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc83Q9D4V3 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc83Q9D4V3 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc83Q9D4V3 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc83Q9D4V3 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc83Q9D4V3 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc83Q9D4V3 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc83Q9D4V3 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc83Q9D4V3 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc83Q9D4V3 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc83Q9D4V3 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc83Q9D4V3 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc83Q9D4V3 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc83Q9D4V3 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc83Q9D4V3 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc83Q9D4V3 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc83Q9D4V3 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc83Q9D4V3 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc83Q9D4V3 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc83Q9D4V3 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc83Q9D4V3 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc83Q9D4V3 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc83Q9D4V3 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc83Q9D4V3 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc83Q9D4V3 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc83Q9D4V3 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc83Q9D4V3 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc83Q9D4V3 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc83Q9D4V3 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc83Q9D4V3 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc83Q9D4V3 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc83Q9D4V3 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc83Q9D4V3 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc83Q9D4V3 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc83Q9D4V3 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc83Q9D4V3 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc83Q9D4V3 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc83Q9D4V3 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc83Q9D4V3 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc83Q9D4V3 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc83Q9D4V3 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc83Q9D4V3 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc83Q9D4V3 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc83Q9D4V3 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc83Q9D4V3 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc83Q9D4V3 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc83Q9D4V3 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ccdc83Q9D4V3 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
Ccdc83Q9D4V3 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc83Q9D4V3 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc83Q9D4V3 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc83Q9D4V3 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc83Q9D4V3 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc83Q9D4V3 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc83Q9D4V3 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc83Q9D4V3 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc83Q9D4V3 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc83Q9D4V3 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc83Q9D4V3 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc83Q9D4V3 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc83Q9D4V3 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc83Q9D4V3 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc83Q9D4V3 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc83Q9D4V3 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc83Q9D4V3 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc83Q9D4V3 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc83Q9D4V3 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc83Q9D4V3 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc83Q9D4V3 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc83Q9D4V3 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc83Q9D4V3 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc83Q9D4V3 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc83Q9D4V3 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc83Q9D4V3 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc83Q9D4V3 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc83Q9D4V3 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc83Q9D4V3 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc83Q9D4V3 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc83Q9D4V3 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc83Q9D4V3 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc83Q9D4V3 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc83Q9D4V3 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc83Q9D4V3 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc83Q9D4V3 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc83Q9D4V3 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc83Q9D4V3 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc83Q9D4V3 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc83Q9D4V3 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms