Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4U7

4930556J24Rik, RIKEN cDNA 4930556J24 gene, mousemouse

Predictions only

Length 146 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930556J24RikQ9D4U7 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
4930556J24RikQ9D4U7 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
4930556J24RikQ9D4U7 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
4930556J24RikQ9D4U7 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.48
4930556J24RikQ9D4U7 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
4930556J24RikQ9D4U7 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.49
4930556J24RikQ9D4U7 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
4930556J24RikQ9D4U7 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
4930556J24RikQ9D4U7 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC12.02□□□□□ -0.49
4930556J24RikQ9D4U7 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
4930556J24RikQ9D4U7 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC12.02□□□□□ -0.49
4930556J24RikQ9D4U7 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC12.02□□□□□ -0.49
4930556J24RikQ9D4U7 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
4930556J24RikQ9D4U7 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
4930556J24RikQ9D4U7 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
4930556J24RikQ9D4U7 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
4930556J24RikQ9D4U7 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
4930556J24RikQ9D4U7 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
4930556J24RikQ9D4U7 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
4930556J24RikQ9D4U7 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
4930556J24RikQ9D4U7 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.49
4930556J24RikQ9D4U7 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
4930556J24RikQ9D4U7 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
4930556J24RikQ9D4U7 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
4930556J24RikQ9D4U7 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
4930556J24RikQ9D4U7 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
4930556J24RikQ9D4U7 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
4930556J24RikQ9D4U7 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
4930556J24RikQ9D4U7 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
4930556J24RikQ9D4U7 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
4930556J24RikQ9D4U7 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
4930556J24RikQ9D4U7 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
4930556J24RikQ9D4U7 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC12.01□□□□□ -0.49
4930556J24RikQ9D4U7 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
4930556J24RikQ9D4U7 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
4930556J24RikQ9D4U7 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC12.01□□□□□ -0.49
4930556J24RikQ9D4U7 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
4930556J24RikQ9D4U7 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
4930556J24RikQ9D4U7 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
4930556J24RikQ9D4U7 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
4930556J24RikQ9D4U7 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
4930556J24RikQ9D4U7 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
4930556J24RikQ9D4U7 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
4930556J24RikQ9D4U7 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
4930556J24RikQ9D4U7 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
4930556J24RikQ9D4U7 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
4930556J24RikQ9D4U7 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
4930556J24RikQ9D4U7 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
4930556J24RikQ9D4U7 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
4930556J24RikQ9D4U7 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
4930556J24RikQ9D4U7 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
4930556J24RikQ9D4U7 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC12□□□□□ -0.49
4930556J24RikQ9D4U7 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
4930556J24RikQ9D4U7 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
4930556J24RikQ9D4U7 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
4930556J24RikQ9D4U7 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC12□□□□□ -0.49
4930556J24RikQ9D4U7 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC12□□□□□ -0.49
4930556J24RikQ9D4U7 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
4930556J24RikQ9D4U7 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
4930556J24RikQ9D4U7 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
4930556J24RikQ9D4U7 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
4930556J24RikQ9D4U7 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
4930556J24RikQ9D4U7 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
4930556J24RikQ9D4U7 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
4930556J24RikQ9D4U7 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
4930556J24RikQ9D4U7 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
4930556J24RikQ9D4U7 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
4930556J24RikQ9D4U7 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC12□□□□□ -0.49
4930556J24RikQ9D4U7 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
4930556J24RikQ9D4U7 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
4930556J24RikQ9D4U7 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
4930556J24RikQ9D4U7 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
4930556J24RikQ9D4U7 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
4930556J24RikQ9D4U7 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
4930556J24RikQ9D4U7 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
4930556J24RikQ9D4U7 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
4930556J24RikQ9D4U7 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
4930556J24RikQ9D4U7 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
4930556J24RikQ9D4U7 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
4930556J24RikQ9D4U7 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
4930556J24RikQ9D4U7 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
4930556J24RikQ9D4U7 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
4930556J24RikQ9D4U7 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
4930556J24RikQ9D4U7 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
4930556J24RikQ9D4U7 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC11.99□□□□□ -0.49
4930556J24RikQ9D4U7 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
4930556J24RikQ9D4U7 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
4930556J24RikQ9D4U7 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
4930556J24RikQ9D4U7 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
4930556J24RikQ9D4U7 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
4930556J24RikQ9D4U7 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
4930556J24RikQ9D4U7 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
4930556J24RikQ9D4U7 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
4930556J24RikQ9D4U7 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
4930556J24RikQ9D4U7 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
4930556J24RikQ9D4U7 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
4930556J24RikQ9D4U7 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
4930556J24RikQ9D4U7 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
4930556J24RikQ9D4U7 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
4930556J24RikQ9D4U7 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms