Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3N5

5430402E10Rik, RIKEN cDNA 5430402E10 gene, mousemouse

Predictions only

Length 173 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
5430402E10RikQ9D3N5 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
5430402E10RikQ9D3N5 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
5430402E10RikQ9D3N5 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
5430402E10RikQ9D3N5 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
5430402E10RikQ9D3N5 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
5430402E10RikQ9D3N5 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
5430402E10RikQ9D3N5 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
5430402E10RikQ9D3N5 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
5430402E10RikQ9D3N5 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
5430402E10RikQ9D3N5 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
5430402E10RikQ9D3N5 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
5430402E10RikQ9D3N5 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
5430402E10RikQ9D3N5 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
5430402E10RikQ9D3N5 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
5430402E10RikQ9D3N5 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
5430402E10RikQ9D3N5 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
5430402E10RikQ9D3N5 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
5430402E10RikQ9D3N5 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
5430402E10RikQ9D3N5 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
5430402E10RikQ9D3N5 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
5430402E10RikQ9D3N5 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
5430402E10RikQ9D3N5 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
5430402E10RikQ9D3N5 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
5430402E10RikQ9D3N5 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
5430402E10RikQ9D3N5 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
5430402E10RikQ9D3N5 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
5430402E10RikQ9D3N5 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
5430402E10RikQ9D3N5 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
5430402E10RikQ9D3N5 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
5430402E10RikQ9D3N5 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
5430402E10RikQ9D3N5 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
5430402E10RikQ9D3N5 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
5430402E10RikQ9D3N5 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
5430402E10RikQ9D3N5 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
5430402E10RikQ9D3N5 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
5430402E10RikQ9D3N5 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
5430402E10RikQ9D3N5 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
5430402E10RikQ9D3N5 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
5430402E10RikQ9D3N5 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
5430402E10RikQ9D3N5 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
5430402E10RikQ9D3N5 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
5430402E10RikQ9D3N5 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
5430402E10RikQ9D3N5 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
5430402E10RikQ9D3N5 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
5430402E10RikQ9D3N5 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
5430402E10RikQ9D3N5 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
5430402E10RikQ9D3N5 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
5430402E10RikQ9D3N5 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
5430402E10RikQ9D3N5 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
5430402E10RikQ9D3N5 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
5430402E10RikQ9D3N5 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
5430402E10RikQ9D3N5 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
5430402E10RikQ9D3N5 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
5430402E10RikQ9D3N5 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
5430402E10RikQ9D3N5 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
5430402E10RikQ9D3N5 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
5430402E10RikQ9D3N5 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
5430402E10RikQ9D3N5 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
5430402E10RikQ9D3N5 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
5430402E10RikQ9D3N5 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
5430402E10RikQ9D3N5 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
5430402E10RikQ9D3N5 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
5430402E10RikQ9D3N5 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
5430402E10RikQ9D3N5 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
5430402E10RikQ9D3N5 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
5430402E10RikQ9D3N5 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
5430402E10RikQ9D3N5 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
5430402E10RikQ9D3N5 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
5430402E10RikQ9D3N5 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
5430402E10RikQ9D3N5 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
5430402E10RikQ9D3N5 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
5430402E10RikQ9D3N5 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
5430402E10RikQ9D3N5 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
5430402E10RikQ9D3N5 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
5430402E10RikQ9D3N5 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
5430402E10RikQ9D3N5 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
5430402E10RikQ9D3N5 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
5430402E10RikQ9D3N5 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
5430402E10RikQ9D3N5 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
5430402E10RikQ9D3N5 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
5430402E10RikQ9D3N5 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
5430402E10RikQ9D3N5 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
5430402E10RikQ9D3N5 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
5430402E10RikQ9D3N5 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
5430402E10RikQ9D3N5 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
5430402E10RikQ9D3N5 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
5430402E10RikQ9D3N5 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
5430402E10RikQ9D3N5 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
5430402E10RikQ9D3N5 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
5430402E10RikQ9D3N5 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
5430402E10RikQ9D3N5 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
5430402E10RikQ9D3N5 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
5430402E10RikQ9D3N5 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
5430402E10RikQ9D3N5 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
5430402E10RikQ9D3N5 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
5430402E10RikQ9D3N5 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
5430402E10RikQ9D3N5 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
5430402E10RikQ9D3N5 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
5430402E10RikQ9D3N5 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
5430402E10RikQ9D3N5 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.6 ms