Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2E1

Tssk3, Testis-specific serine/threonine-protein kinase 3, mousemouse

Predictions only

Length 268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tssk3Q9D2E1 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tssk3Q9D2E1 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tssk3Q9D2E1 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tssk3Q9D2E1 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tssk3Q9D2E1 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Tssk3Q9D2E1 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tssk3Q9D2E1 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Tssk3Q9D2E1 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tssk3Q9D2E1 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tssk3Q9D2E1 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tssk3Q9D2E1 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tssk3Q9D2E1 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tssk3Q9D2E1 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Tssk3Q9D2E1 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Tssk3Q9D2E1 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Tssk3Q9D2E1 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Tssk3Q9D2E1 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Tssk3Q9D2E1 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tssk3Q9D2E1 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tssk3Q9D2E1 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tssk3Q9D2E1 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tssk3Q9D2E1 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tssk3Q9D2E1 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tssk3Q9D2E1 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tssk3Q9D2E1 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tssk3Q9D2E1 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tssk3Q9D2E1 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tssk3Q9D2E1 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tssk3Q9D2E1 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tssk3Q9D2E1 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tssk3Q9D2E1 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Tssk3Q9D2E1 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Tssk3Q9D2E1 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tssk3Q9D2E1 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tssk3Q9D2E1 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tssk3Q9D2E1 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tssk3Q9D2E1 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tssk3Q9D2E1 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tssk3Q9D2E1 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tssk3Q9D2E1 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tssk3Q9D2E1 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tssk3Q9D2E1 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tssk3Q9D2E1 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tssk3Q9D2E1 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tssk3Q9D2E1 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tssk3Q9D2E1 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tssk3Q9D2E1 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tssk3Q9D2E1 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Tssk3Q9D2E1 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tssk3Q9D2E1 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tssk3Q9D2E1 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tssk3Q9D2E1 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tssk3Q9D2E1 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tssk3Q9D2E1 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tssk3Q9D2E1 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Tssk3Q9D2E1 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tssk3Q9D2E1 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tssk3Q9D2E1 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Tssk3Q9D2E1 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Tssk3Q9D2E1 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tssk3Q9D2E1 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Tssk3Q9D2E1 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tssk3Q9D2E1 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Tssk3Q9D2E1 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tssk3Q9D2E1 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tssk3Q9D2E1 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tssk3Q9D2E1 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tssk3Q9D2E1 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Tssk3Q9D2E1 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Tssk3Q9D2E1 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Tssk3Q9D2E1 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tssk3Q9D2E1 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tssk3Q9D2E1 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tssk3Q9D2E1 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tssk3Q9D2E1 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tssk3Q9D2E1 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tssk3Q9D2E1 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tssk3Q9D2E1 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tssk3Q9D2E1 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tssk3Q9D2E1 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tssk3Q9D2E1 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tssk3Q9D2E1 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tssk3Q9D2E1 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tssk3Q9D2E1 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tssk3Q9D2E1 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tssk3Q9D2E1 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tssk3Q9D2E1 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tssk3Q9D2E1 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tssk3Q9D2E1 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tssk3Q9D2E1 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tssk3Q9D2E1 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tssk3Q9D2E1 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tssk3Q9D2E1 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tssk3Q9D2E1 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tssk3Q9D2E1 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tssk3Q9D2E1 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tssk3Q9D2E1 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tssk3Q9D2E1 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tssk3Q9D2E1 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tssk3Q9D2E1 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms