Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1F0

Rtl8b, CAAX box 1 homolog A (Human), mousemouse

Predictions only

Length 113 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtl8bQ9D1F0 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rtl8bQ9D1F0 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rtl8bQ9D1F0 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rtl8bQ9D1F0 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rtl8bQ9D1F0 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rtl8bQ9D1F0 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rtl8bQ9D1F0 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rtl8bQ9D1F0 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rtl8bQ9D1F0 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rtl8bQ9D1F0 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rtl8bQ9D1F0 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rtl8bQ9D1F0 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rtl8bQ9D1F0 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rtl8bQ9D1F0 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rtl8bQ9D1F0 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rtl8bQ9D1F0 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rtl8bQ9D1F0 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rtl8bQ9D1F0 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rtl8bQ9D1F0 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rtl8bQ9D1F0 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rtl8bQ9D1F0 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rtl8bQ9D1F0 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rtl8bQ9D1F0 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rtl8bQ9D1F0 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rtl8bQ9D1F0 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rtl8bQ9D1F0 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rtl8bQ9D1F0 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rtl8bQ9D1F0 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rtl8bQ9D1F0 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rtl8bQ9D1F0 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rtl8bQ9D1F0 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rtl8bQ9D1F0 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rtl8bQ9D1F0 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rtl8bQ9D1F0 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rtl8bQ9D1F0 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rtl8bQ9D1F0 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rtl8bQ9D1F0 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rtl8bQ9D1F0 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rtl8bQ9D1F0 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rtl8bQ9D1F0 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rtl8bQ9D1F0 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rtl8bQ9D1F0 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rtl8bQ9D1F0 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Rtl8bQ9D1F0 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rtl8bQ9D1F0 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rtl8bQ9D1F0 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rtl8bQ9D1F0 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rtl8bQ9D1F0 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rtl8bQ9D1F0 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rtl8bQ9D1F0 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rtl8bQ9D1F0 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rtl8bQ9D1F0 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rtl8bQ9D1F0 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rtl8bQ9D1F0 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rtl8bQ9D1F0 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rtl8bQ9D1F0 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rtl8bQ9D1F0 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rtl8bQ9D1F0 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rtl8bQ9D1F0 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rtl8bQ9D1F0 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rtl8bQ9D1F0 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rtl8bQ9D1F0 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rtl8bQ9D1F0 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rtl8bQ9D1F0 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rtl8bQ9D1F0 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rtl8bQ9D1F0 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rtl8bQ9D1F0 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rtl8bQ9D1F0 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rtl8bQ9D1F0 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rtl8bQ9D1F0 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rtl8bQ9D1F0 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rtl8bQ9D1F0 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rtl8bQ9D1F0 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rtl8bQ9D1F0 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rtl8bQ9D1F0 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rtl8bQ9D1F0 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rtl8bQ9D1F0 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rtl8bQ9D1F0 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rtl8bQ9D1F0 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rtl8bQ9D1F0 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rtl8bQ9D1F0 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rtl8bQ9D1F0 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rtl8bQ9D1F0 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Rtl8bQ9D1F0 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rtl8bQ9D1F0 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rtl8bQ9D1F0 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rtl8bQ9D1F0 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rtl8bQ9D1F0 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rtl8bQ9D1F0 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rtl8bQ9D1F0 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rtl8bQ9D1F0 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rtl8bQ9D1F0 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rtl8bQ9D1F0 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rtl8bQ9D1F0 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rtl8bQ9D1F0 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rtl8bQ9D1F0 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rtl8bQ9D1F0 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rtl8bQ9D1F0 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rtl8bQ9D1F0 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rtl8bQ9D1F0 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms