Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1E4

Cysrt1, Cysteine-rich tail protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cysrt1Q9D1E4 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cysrt1Q9D1E4 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cysrt1Q9D1E4 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Cysrt1Q9D1E4 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cysrt1Q9D1E4 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Cysrt1Q9D1E4 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Cysrt1Q9D1E4 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cysrt1Q9D1E4 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cysrt1Q9D1E4 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Cysrt1Q9D1E4 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Cysrt1Q9D1E4 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cysrt1Q9D1E4 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cysrt1Q9D1E4 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cysrt1Q9D1E4 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cysrt1Q9D1E4 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cysrt1Q9D1E4 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cysrt1Q9D1E4 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cysrt1Q9D1E4 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cysrt1Q9D1E4 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cysrt1Q9D1E4 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cysrt1Q9D1E4 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cysrt1Q9D1E4 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cysrt1Q9D1E4 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cysrt1Q9D1E4 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cysrt1Q9D1E4 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cysrt1Q9D1E4 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cysrt1Q9D1E4 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cysrt1Q9D1E4 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cysrt1Q9D1E4 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cysrt1Q9D1E4 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cysrt1Q9D1E4 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cysrt1Q9D1E4 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cysrt1Q9D1E4 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Cysrt1Q9D1E4 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cysrt1Q9D1E4 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cysrt1Q9D1E4 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cysrt1Q9D1E4 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cysrt1Q9D1E4 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cysrt1Q9D1E4 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cysrt1Q9D1E4 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cysrt1Q9D1E4 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cysrt1Q9D1E4 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cysrt1Q9D1E4 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cysrt1Q9D1E4 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Cysrt1Q9D1E4 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Cysrt1Q9D1E4 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cysrt1Q9D1E4 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cysrt1Q9D1E4 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cysrt1Q9D1E4 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cysrt1Q9D1E4 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cysrt1Q9D1E4 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cysrt1Q9D1E4 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cysrt1Q9D1E4 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cysrt1Q9D1E4 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cysrt1Q9D1E4 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cysrt1Q9D1E4 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cysrt1Q9D1E4 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cysrt1Q9D1E4 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cysrt1Q9D1E4 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cysrt1Q9D1E4 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cysrt1Q9D1E4 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cysrt1Q9D1E4 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cysrt1Q9D1E4 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cysrt1Q9D1E4 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cysrt1Q9D1E4 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cysrt1Q9D1E4 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cysrt1Q9D1E4 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cysrt1Q9D1E4 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cysrt1Q9D1E4 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cysrt1Q9D1E4 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cysrt1Q9D1E4 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cysrt1Q9D1E4 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cysrt1Q9D1E4 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cysrt1Q9D1E4 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cysrt1Q9D1E4 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cysrt1Q9D1E4 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cysrt1Q9D1E4 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cysrt1Q9D1E4 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cysrt1Q9D1E4 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cysrt1Q9D1E4 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Cysrt1Q9D1E4 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cysrt1Q9D1E4 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Cysrt1Q9D1E4 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cysrt1Q9D1E4 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cysrt1Q9D1E4 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cysrt1Q9D1E4 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cysrt1Q9D1E4 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cysrt1Q9D1E4 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cysrt1Q9D1E4 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Cysrt1Q9D1E4 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cysrt1Q9D1E4 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cysrt1Q9D1E4 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cysrt1Q9D1E4 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cysrt1Q9D1E4 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cysrt1Q9D1E4 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cysrt1Q9D1E4 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cysrt1Q9D1E4 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Cysrt1Q9D1E4 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cysrt1Q9D1E4 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cysrt1Q9D1E4 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms