Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZT6

Cmss1, Protein CMSS1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 276 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cmss1Q9CZT6 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cmss1Q9CZT6 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cmss1Q9CZT6 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cmss1Q9CZT6 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cmss1Q9CZT6 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cmss1Q9CZT6 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cmss1Q9CZT6 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cmss1Q9CZT6 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Cmss1Q9CZT6 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cmss1Q9CZT6 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cmss1Q9CZT6 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cmss1Q9CZT6 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cmss1Q9CZT6 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cmss1Q9CZT6 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cmss1Q9CZT6 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cmss1Q9CZT6 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cmss1Q9CZT6 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cmss1Q9CZT6 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cmss1Q9CZT6 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cmss1Q9CZT6 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Cmss1Q9CZT6 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cmss1Q9CZT6 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cmss1Q9CZT6 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cmss1Q9CZT6 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cmss1Q9CZT6 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cmss1Q9CZT6 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cmss1Q9CZT6 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cmss1Q9CZT6 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cmss1Q9CZT6 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cmss1Q9CZT6 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cmss1Q9CZT6 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cmss1Q9CZT6 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cmss1Q9CZT6 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cmss1Q9CZT6 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cmss1Q9CZT6 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cmss1Q9CZT6 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cmss1Q9CZT6 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cmss1Q9CZT6 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cmss1Q9CZT6 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cmss1Q9CZT6 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cmss1Q9CZT6 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Cmss1Q9CZT6 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cmss1Q9CZT6 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cmss1Q9CZT6 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cmss1Q9CZT6 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Cmss1Q9CZT6 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cmss1Q9CZT6 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cmss1Q9CZT6 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cmss1Q9CZT6 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Cmss1Q9CZT6 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cmss1Q9CZT6 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cmss1Q9CZT6 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cmss1Q9CZT6 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cmss1Q9CZT6 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cmss1Q9CZT6 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cmss1Q9CZT6 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cmss1Q9CZT6 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cmss1Q9CZT6 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Cmss1Q9CZT6 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cmss1Q9CZT6 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cmss1Q9CZT6 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cmss1Q9CZT6 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cmss1Q9CZT6 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cmss1Q9CZT6 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cmss1Q9CZT6 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cmss1Q9CZT6 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cmss1Q9CZT6 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cmss1Q9CZT6 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cmss1Q9CZT6 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cmss1Q9CZT6 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cmss1Q9CZT6 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cmss1Q9CZT6 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cmss1Q9CZT6 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cmss1Q9CZT6 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cmss1Q9CZT6 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cmss1Q9CZT6 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Cmss1Q9CZT6 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cmss1Q9CZT6 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cmss1Q9CZT6 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cmss1Q9CZT6 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cmss1Q9CZT6 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cmss1Q9CZT6 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cmss1Q9CZT6 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cmss1Q9CZT6 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cmss1Q9CZT6 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cmss1Q9CZT6 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cmss1Q9CZT6 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cmss1Q9CZT6 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cmss1Q9CZT6 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cmss1Q9CZT6 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cmss1Q9CZT6 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cmss1Q9CZT6 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cmss1Q9CZT6 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cmss1Q9CZT6 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cmss1Q9CZT6 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cmss1Q9CZT6 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cmss1Q9CZT6 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cmss1Q9CZT6 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cmss1Q9CZT6 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Cmss1Q9CZT6 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.8 ms