Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZN7

Shmt2, Serine hydroxymethyltransferase, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 504 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shmt2Q9CZN7 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Shmt2Q9CZN7 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Shmt2Q9CZN7 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Shmt2Q9CZN7 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Shmt2Q9CZN7 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Shmt2Q9CZN7 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Shmt2Q9CZN7 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Shmt2Q9CZN7 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Shmt2Q9CZN7 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Shmt2Q9CZN7 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Shmt2Q9CZN7 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Shmt2Q9CZN7 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Shmt2Q9CZN7 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Shmt2Q9CZN7 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Shmt2Q9CZN7 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Shmt2Q9CZN7 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Shmt2Q9CZN7 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Shmt2Q9CZN7 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Shmt2Q9CZN7 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Shmt2Q9CZN7 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Shmt2Q9CZN7 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Shmt2Q9CZN7 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Shmt2Q9CZN7 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Shmt2Q9CZN7 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Shmt2Q9CZN7 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Shmt2Q9CZN7 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Shmt2Q9CZN7 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Shmt2Q9CZN7 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Shmt2Q9CZN7 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Shmt2Q9CZN7 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Shmt2Q9CZN7 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Shmt2Q9CZN7 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Shmt2Q9CZN7 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Shmt2Q9CZN7 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Shmt2Q9CZN7 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Shmt2Q9CZN7 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Shmt2Q9CZN7 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Shmt2Q9CZN7 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Shmt2Q9CZN7 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Shmt2Q9CZN7 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Shmt2Q9CZN7 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Shmt2Q9CZN7 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Shmt2Q9CZN7 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Shmt2Q9CZN7 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Shmt2Q9CZN7 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Shmt2Q9CZN7 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Shmt2Q9CZN7 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Shmt2Q9CZN7 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Shmt2Q9CZN7 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Shmt2Q9CZN7 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Shmt2Q9CZN7 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Shmt2Q9CZN7 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Shmt2Q9CZN7 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Shmt2Q9CZN7 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Shmt2Q9CZN7 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Shmt2Q9CZN7 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Shmt2Q9CZN7 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Shmt2Q9CZN7 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Shmt2Q9CZN7 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Shmt2Q9CZN7 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Shmt2Q9CZN7 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Shmt2Q9CZN7 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Shmt2Q9CZN7 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Shmt2Q9CZN7 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Shmt2Q9CZN7 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Shmt2Q9CZN7 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
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Shmt2Q9CZN7 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Shmt2Q9CZN7 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Shmt2Q9CZN7 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Shmt2Q9CZN7 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Shmt2Q9CZN7 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Shmt2Q9CZN7 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Shmt2Q9CZN7 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Shmt2Q9CZN7 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Shmt2Q9CZN7 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Shmt2Q9CZN7 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Shmt2Q9CZN7 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Shmt2Q9CZN7 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Shmt2Q9CZN7 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Shmt2Q9CZN7 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
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Shmt2Q9CZN7 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Shmt2Q9CZN7 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Shmt2Q9CZN7 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Shmt2Q9CZN7 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Shmt2Q9CZN7 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Shmt2Q9CZN7 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Shmt2Q9CZN7 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Shmt2Q9CZN7 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Shmt2Q9CZN7 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Shmt2Q9CZN7 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Shmt2Q9CZN7 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Shmt2Q9CZN7 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Shmt2Q9CZN7 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Shmt2Q9CZN7 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Shmt2Q9CZN7 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Shmt2Q9CZN7 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Shmt2Q9CZN7 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Shmt2Q9CZN7 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39 ms