Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZ83

Mrpl55, 39S ribosomal protein L55, mitochondrial, mousemouse

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Length 127 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl55Q9CZ83 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Mrpl55Q9CZ83 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Mrpl55Q9CZ83 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Mrpl55Q9CZ83 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Mrpl55Q9CZ83 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Mrpl55Q9CZ83 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Mrpl55Q9CZ83 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Mrpl55Q9CZ83 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Mrpl55Q9CZ83 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Mrpl55Q9CZ83 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Mrpl55Q9CZ83 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Mrpl55Q9CZ83 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Mrpl55Q9CZ83 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Mrpl55Q9CZ83 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Mrpl55Q9CZ83 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Mrpl55Q9CZ83 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Mrpl55Q9CZ83 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Mrpl55Q9CZ83 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Mrpl55Q9CZ83 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Mrpl55Q9CZ83 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Mrpl55Q9CZ83 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Mrpl55Q9CZ83 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Mrpl55Q9CZ83 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Mrpl55Q9CZ83 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Mrpl55Q9CZ83 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Mrpl55Q9CZ83 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Mrpl55Q9CZ83 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Mrpl55Q9CZ83 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Mrpl55Q9CZ83 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Mrpl55Q9CZ83 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Mrpl55Q9CZ83 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Mrpl55Q9CZ83 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Mrpl55Q9CZ83 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Mrpl55Q9CZ83 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Mrpl55Q9CZ83 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Mrpl55Q9CZ83 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Mrpl55Q9CZ83 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Mrpl55Q9CZ83 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Mrpl55Q9CZ83 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Mrpl55Q9CZ83 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Mrpl55Q9CZ83 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Mrpl55Q9CZ83 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Mrpl55Q9CZ83 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Mrpl55Q9CZ83 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Mrpl55Q9CZ83 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Mrpl55Q9CZ83 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Mrpl55Q9CZ83 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Mrpl55Q9CZ83 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Mrpl55Q9CZ83 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Mrpl55Q9CZ83 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Mrpl55Q9CZ83 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Mrpl55Q9CZ83 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Mrpl55Q9CZ83 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Mrpl55Q9CZ83 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Mrpl55Q9CZ83 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Mrpl55Q9CZ83 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Mrpl55Q9CZ83 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Mrpl55Q9CZ83 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Mrpl55Q9CZ83 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Mrpl55Q9CZ83 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Mrpl55Q9CZ83 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Mrpl55Q9CZ83 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Mrpl55Q9CZ83 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
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Mrpl55Q9CZ83 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Mrpl55Q9CZ83 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Mrpl55Q9CZ83 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Mrpl55Q9CZ83 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Mrpl55Q9CZ83 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Mrpl55Q9CZ83 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Mrpl55Q9CZ83 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Mrpl55Q9CZ83 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Mrpl55Q9CZ83 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Mrpl55Q9CZ83 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Mrpl55Q9CZ83 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Mrpl55Q9CZ83 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Mrpl55Q9CZ83 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Mrpl55Q9CZ83 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Mrpl55Q9CZ83 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Mrpl55Q9CZ83 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Mrpl55Q9CZ83 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Mrpl55Q9CZ83 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Mrpl55Q9CZ83 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Mrpl55Q9CZ83 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Mrpl55Q9CZ83 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Mrpl55Q9CZ83 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Mrpl55Q9CZ83 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Mrpl55Q9CZ83 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Mrpl55Q9CZ83 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Mrpl55Q9CZ83 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Mrpl55Q9CZ83 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Mrpl55Q9CZ83 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Mrpl55Q9CZ83 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Mrpl55Q9CZ83 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Mrpl55Q9CZ83 Asxl1-201ENSMUST00000109790 6968 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Mrpl55Q9CZ83 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Mrpl55Q9CZ83 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Mrpl55Q9CZ83 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Mrpl55Q9CZ83 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms