Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWY9

Rpain, RPA-interacting protein, mousemouse

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Length 219 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RpainQ9CWY9 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RpainQ9CWY9 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RpainQ9CWY9 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RpainQ9CWY9 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RpainQ9CWY9 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RpainQ9CWY9 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RpainQ9CWY9 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RpainQ9CWY9 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RpainQ9CWY9 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RpainQ9CWY9 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RpainQ9CWY9 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RpainQ9CWY9 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RpainQ9CWY9 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RpainQ9CWY9 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RpainQ9CWY9 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RpainQ9CWY9 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RpainQ9CWY9 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
RpainQ9CWY9 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
RpainQ9CWY9 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RpainQ9CWY9 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RpainQ9CWY9 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RpainQ9CWY9 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RpainQ9CWY9 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RpainQ9CWY9 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RpainQ9CWY9 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
RpainQ9CWY9 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RpainQ9CWY9 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RpainQ9CWY9 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RpainQ9CWY9 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RpainQ9CWY9 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
RpainQ9CWY9 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
RpainQ9CWY9 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RpainQ9CWY9 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RpainQ9CWY9 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RpainQ9CWY9 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RpainQ9CWY9 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
RpainQ9CWY9 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RpainQ9CWY9 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
RpainQ9CWY9 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RpainQ9CWY9 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RpainQ9CWY9 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RpainQ9CWY9 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RpainQ9CWY9 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RpainQ9CWY9 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RpainQ9CWY9 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RpainQ9CWY9 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RpainQ9CWY9 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RpainQ9CWY9 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RpainQ9CWY9 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RpainQ9CWY9 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RpainQ9CWY9 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RpainQ9CWY9 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RpainQ9CWY9 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
RpainQ9CWY9 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RpainQ9CWY9 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
RpainQ9CWY9 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RpainQ9CWY9 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RpainQ9CWY9 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RpainQ9CWY9 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RpainQ9CWY9 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RpainQ9CWY9 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RpainQ9CWY9 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RpainQ9CWY9 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RpainQ9CWY9 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RpainQ9CWY9 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RpainQ9CWY9 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RpainQ9CWY9 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RpainQ9CWY9 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RpainQ9CWY9 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RpainQ9CWY9 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RpainQ9CWY9 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RpainQ9CWY9 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RpainQ9CWY9 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RpainQ9CWY9 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RpainQ9CWY9 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RpainQ9CWY9 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RpainQ9CWY9 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RpainQ9CWY9 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RpainQ9CWY9 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RpainQ9CWY9 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RpainQ9CWY9 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RpainQ9CWY9 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RpainQ9CWY9 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RpainQ9CWY9 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RpainQ9CWY9 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RpainQ9CWY9 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RpainQ9CWY9 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RpainQ9CWY9 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RpainQ9CWY9 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RpainQ9CWY9 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
RpainQ9CWY9 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RpainQ9CWY9 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RpainQ9CWY9 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RpainQ9CWY9 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RpainQ9CWY9 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
RpainQ9CWY9 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RpainQ9CWY9 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RpainQ9CWY9 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RpainQ9CWY9 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RpainQ9CWY9 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35 ms