Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWX4

Rpusd4, Mitochondrial RNA pseudouridine synthase Rpusd4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd4Q9CWX4 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rpusd4Q9CWX4 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rpusd4Q9CWX4 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rpusd4Q9CWX4 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rpusd4Q9CWX4 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rpusd4Q9CWX4 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rpusd4Q9CWX4 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rpusd4Q9CWX4 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Rpusd4Q9CWX4 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rpusd4Q9CWX4 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rpusd4Q9CWX4 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rpusd4Q9CWX4 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rpusd4Q9CWX4 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rpusd4Q9CWX4 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rpusd4Q9CWX4 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rpusd4Q9CWX4 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rpusd4Q9CWX4 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rpusd4Q9CWX4 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rpusd4Q9CWX4 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rpusd4Q9CWX4 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rpusd4Q9CWX4 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rpusd4Q9CWX4 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Rpusd4Q9CWX4 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rpusd4Q9CWX4 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rpusd4Q9CWX4 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rpusd4Q9CWX4 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rpusd4Q9CWX4 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rpusd4Q9CWX4 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rpusd4Q9CWX4 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rpusd4Q9CWX4 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rpusd4Q9CWX4 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rpusd4Q9CWX4 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rpusd4Q9CWX4 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rpusd4Q9CWX4 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rpusd4Q9CWX4 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rpusd4Q9CWX4 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rpusd4Q9CWX4 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rpusd4Q9CWX4 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rpusd4Q9CWX4 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rpusd4Q9CWX4 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rpusd4Q9CWX4 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rpusd4Q9CWX4 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rpusd4Q9CWX4 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rpusd4Q9CWX4 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rpusd4Q9CWX4 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rpusd4Q9CWX4 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rpusd4Q9CWX4 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rpusd4Q9CWX4 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rpusd4Q9CWX4 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Rpusd4Q9CWX4 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Rpusd4Q9CWX4 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Rpusd4Q9CWX4 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rpusd4Q9CWX4 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rpusd4Q9CWX4 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rpusd4Q9CWX4 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rpusd4Q9CWX4 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rpusd4Q9CWX4 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rpusd4Q9CWX4 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rpusd4Q9CWX4 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rpusd4Q9CWX4 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rpusd4Q9CWX4 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Rpusd4Q9CWX4 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rpusd4Q9CWX4 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rpusd4Q9CWX4 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rpusd4Q9CWX4 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Rpusd4Q9CWX4 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rpusd4Q9CWX4 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rpusd4Q9CWX4 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rpusd4Q9CWX4 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rpusd4Q9CWX4 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rpusd4Q9CWX4 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rpusd4Q9CWX4 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Rpusd4Q9CWX4 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rpusd4Q9CWX4 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rpusd4Q9CWX4 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rpusd4Q9CWX4 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rpusd4Q9CWX4 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rpusd4Q9CWX4 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rpusd4Q9CWX4 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rpusd4Q9CWX4 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rpusd4Q9CWX4 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rpusd4Q9CWX4 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rpusd4Q9CWX4 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rpusd4Q9CWX4 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rpusd4Q9CWX4 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rpusd4Q9CWX4 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rpusd4Q9CWX4 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rpusd4Q9CWX4 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rpusd4Q9CWX4 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rpusd4Q9CWX4 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rpusd4Q9CWX4 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rpusd4Q9CWX4 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rpusd4Q9CWX4 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rpusd4Q9CWX4 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rpusd4Q9CWX4 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rpusd4Q9CWX4 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rpusd4Q9CWX4 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rpusd4Q9CWX4 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rpusd4Q9CWX4 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rpusd4Q9CWX4 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms