Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWV0

Malsu1, Mitochondrial assembly of ribosomal large subunit protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Malsu1Q9CWV0 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Malsu1Q9CWV0 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Malsu1Q9CWV0 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Malsu1Q9CWV0 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Malsu1Q9CWV0 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Malsu1Q9CWV0 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Malsu1Q9CWV0 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Malsu1Q9CWV0 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Malsu1Q9CWV0 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Malsu1Q9CWV0 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Malsu1Q9CWV0 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Malsu1Q9CWV0 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Malsu1Q9CWV0 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Malsu1Q9CWV0 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Malsu1Q9CWV0 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Malsu1Q9CWV0 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Malsu1Q9CWV0 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Malsu1Q9CWV0 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Malsu1Q9CWV0 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Malsu1Q9CWV0 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Malsu1Q9CWV0 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Malsu1Q9CWV0 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Malsu1Q9CWV0 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Malsu1Q9CWV0 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Malsu1Q9CWV0 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Malsu1Q9CWV0 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Malsu1Q9CWV0 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Malsu1Q9CWV0 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Malsu1Q9CWV0 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Malsu1Q9CWV0 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Malsu1Q9CWV0 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Malsu1Q9CWV0 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Malsu1Q9CWV0 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Malsu1Q9CWV0 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Malsu1Q9CWV0 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Malsu1Q9CWV0 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Malsu1Q9CWV0 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Malsu1Q9CWV0 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Malsu1Q9CWV0 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Malsu1Q9CWV0 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Malsu1Q9CWV0 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Malsu1Q9CWV0 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Malsu1Q9CWV0 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Malsu1Q9CWV0 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Malsu1Q9CWV0 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Malsu1Q9CWV0 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Malsu1Q9CWV0 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Malsu1Q9CWV0 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Malsu1Q9CWV0 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Malsu1Q9CWV0 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Malsu1Q9CWV0 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Malsu1Q9CWV0 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Malsu1Q9CWV0 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Malsu1Q9CWV0 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Malsu1Q9CWV0 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Malsu1Q9CWV0 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Malsu1Q9CWV0 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Malsu1Q9CWV0 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Malsu1Q9CWV0 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Malsu1Q9CWV0 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Malsu1Q9CWV0 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Malsu1Q9CWV0 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Malsu1Q9CWV0 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Malsu1Q9CWV0 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Malsu1Q9CWV0 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Malsu1Q9CWV0 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Malsu1Q9CWV0 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Malsu1Q9CWV0 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Malsu1Q9CWV0 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Malsu1Q9CWV0 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Malsu1Q9CWV0 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Malsu1Q9CWV0 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Malsu1Q9CWV0 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Malsu1Q9CWV0 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Malsu1Q9CWV0 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Malsu1Q9CWV0 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Malsu1Q9CWV0 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Malsu1Q9CWV0 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Malsu1Q9CWV0 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Malsu1Q9CWV0 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Malsu1Q9CWV0 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Malsu1Q9CWV0 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Malsu1Q9CWV0 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Malsu1Q9CWV0 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Malsu1Q9CWV0 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Malsu1Q9CWV0 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Malsu1Q9CWV0 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Malsu1Q9CWV0 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Malsu1Q9CWV0 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Malsu1Q9CWV0 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Malsu1Q9CWV0 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Malsu1Q9CWV0 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Malsu1Q9CWV0 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Malsu1Q9CWV0 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Malsu1Q9CWV0 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Malsu1Q9CWV0 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Malsu1Q9CWV0 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Malsu1Q9CWV0 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Malsu1Q9CWV0 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Malsu1Q9CWV0 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms