Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWU4

UPF0690 protein C1orf52 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9CWU4 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Q9CWU4 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Q9CWU4 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Q9CWU4 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Q9CWU4 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Q9CWU4 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Q9CWU4 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Q9CWU4 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Q9CWU4 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Q9CWU4 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Q9CWU4 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Q9CWU4 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Q9CWU4 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Q9CWU4 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Q9CWU4 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Q9CWU4 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Q9CWU4 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Q9CWU4 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Q9CWU4 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Q9CWU4 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Q9CWU4 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Q9CWU4 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Q9CWU4 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Q9CWU4 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Q9CWU4 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Q9CWU4 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Q9CWU4 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Q9CWU4 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Q9CWU4 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Q9CWU4 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Q9CWU4 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Q9CWU4 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Q9CWU4 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Q9CWU4 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Q9CWU4 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Q9CWU4 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Q9CWU4 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Q9CWU4 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Q9CWU4 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Q9CWU4 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Q9CWU4 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Q9CWU4 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Q9CWU4 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Q9CWU4 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Q9CWU4 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Q9CWU4 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Q9CWU4 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Q9CWU4 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Q9CWU4 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Q9CWU4 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Q9CWU4 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Q9CWU4 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Q9CWU4 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Q9CWU4 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Q9CWU4 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Q9CWU4 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Q9CWU4 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Q9CWU4 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Q9CWU4 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Q9CWU4 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Q9CWU4 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Q9CWU4 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Q9CWU4 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Q9CWU4 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Q9CWU4 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Q9CWU4 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Q9CWU4 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Q9CWU4 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Q9CWU4 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Q9CWU4 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Q9CWU4 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Q9CWU4 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Q9CWU4 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Q9CWU4 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Q9CWU4 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Q9CWU4 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Q9CWU4 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Q9CWU4 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Q9CWU4 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Q9CWU4 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Q9CWU4 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Q9CWU4 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Q9CWU4 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Q9CWU4 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Q9CWU4 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Q9CWU4 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Q9CWU4 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Q9CWU4 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Q9CWU4 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Q9CWU4 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Q9CWU4 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Q9CWU4 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Q9CWU4 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Q9CWU4 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Q9CWU4 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Q9CWU4 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Q9CWU4 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Q9CWU4 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Q9CWU4 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Q9CWU4 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.6 ms