Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWU0

Tdrd12, Putative ATP-dependent RNA helicase TDRD12, mousemouse

Predictions only

Length 1,215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tdrd12Q9CWU0 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tdrd12Q9CWU0 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tdrd12Q9CWU0 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tdrd12Q9CWU0 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tdrd12Q9CWU0 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tdrd12Q9CWU0 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tdrd12Q9CWU0 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tdrd12Q9CWU0 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tdrd12Q9CWU0 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tdrd12Q9CWU0 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tdrd12Q9CWU0 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tdrd12Q9CWU0 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tdrd12Q9CWU0 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tdrd12Q9CWU0 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tdrd12Q9CWU0 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tdrd12Q9CWU0 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Tdrd12Q9CWU0 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tdrd12Q9CWU0 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tdrd12Q9CWU0 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tdrd12Q9CWU0 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tdrd12Q9CWU0 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tdrd12Q9CWU0 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tdrd12Q9CWU0 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tdrd12Q9CWU0 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tdrd12Q9CWU0 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tdrd12Q9CWU0 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tdrd12Q9CWU0 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tdrd12Q9CWU0 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tdrd12Q9CWU0 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tdrd12Q9CWU0 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tdrd12Q9CWU0 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tdrd12Q9CWU0 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tdrd12Q9CWU0 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tdrd12Q9CWU0 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tdrd12Q9CWU0 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tdrd12Q9CWU0 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tdrd12Q9CWU0 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tdrd12Q9CWU0 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tdrd12Q9CWU0 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Tdrd12Q9CWU0 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tdrd12Q9CWU0 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tdrd12Q9CWU0 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tdrd12Q9CWU0 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Tdrd12Q9CWU0 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tdrd12Q9CWU0 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tdrd12Q9CWU0 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tdrd12Q9CWU0 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tdrd12Q9CWU0 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tdrd12Q9CWU0 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tdrd12Q9CWU0 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tdrd12Q9CWU0 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tdrd12Q9CWU0 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tdrd12Q9CWU0 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tdrd12Q9CWU0 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tdrd12Q9CWU0 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tdrd12Q9CWU0 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tdrd12Q9CWU0 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tdrd12Q9CWU0 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tdrd12Q9CWU0 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tdrd12Q9CWU0 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tdrd12Q9CWU0 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tdrd12Q9CWU0 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tdrd12Q9CWU0 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tdrd12Q9CWU0 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tdrd12Q9CWU0 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Tdrd12Q9CWU0 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tdrd12Q9CWU0 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Tdrd12Q9CWU0 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tdrd12Q9CWU0 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tdrd12Q9CWU0 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tdrd12Q9CWU0 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tdrd12Q9CWU0 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tdrd12Q9CWU0 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tdrd12Q9CWU0 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tdrd12Q9CWU0 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tdrd12Q9CWU0 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tdrd12Q9CWU0 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tdrd12Q9CWU0 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tdrd12Q9CWU0 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tdrd12Q9CWU0 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tdrd12Q9CWU0 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tdrd12Q9CWU0 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tdrd12Q9CWU0 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tdrd12Q9CWU0 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tdrd12Q9CWU0 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tdrd12Q9CWU0 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tdrd12Q9CWU0 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tdrd12Q9CWU0 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Tdrd12Q9CWU0 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tdrd12Q9CWU0 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Tdrd12Q9CWU0 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tdrd12Q9CWU0 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tdrd12Q9CWU0 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tdrd12Q9CWU0 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tdrd12Q9CWU0 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tdrd12Q9CWU0 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tdrd12Q9CWU0 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tdrd12Q9CWU0 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Tdrd12Q9CWU0 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tdrd12Q9CWU0 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms