Protein–RNA interactions for Protein: Q9CVD2

Atxn3, Ataxin-3, mousemouse

Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atxn3Q9CVD2 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Atxn3Q9CVD2 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Atxn3Q9CVD2 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Atxn3Q9CVD2 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Atxn3Q9CVD2 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Atxn3Q9CVD2 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Atxn3Q9CVD2 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Atxn3Q9CVD2 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Atxn3Q9CVD2 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Atxn3Q9CVD2 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Atxn3Q9CVD2 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Atxn3Q9CVD2 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Atxn3Q9CVD2 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Atxn3Q9CVD2 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Atxn3Q9CVD2 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Atxn3Q9CVD2 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Atxn3Q9CVD2 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Atxn3Q9CVD2 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Atxn3Q9CVD2 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Atxn3Q9CVD2 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Atxn3Q9CVD2 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Atxn3Q9CVD2 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Atxn3Q9CVD2 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Atxn3Q9CVD2 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Atxn3Q9CVD2 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Atxn3Q9CVD2 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Atxn3Q9CVD2 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Atxn3Q9CVD2 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Atxn3Q9CVD2 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Atxn3Q9CVD2 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Atxn3Q9CVD2 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Atxn3Q9CVD2 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Atxn3Q9CVD2 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Atxn3Q9CVD2 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Atxn3Q9CVD2 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Atxn3Q9CVD2 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Atxn3Q9CVD2 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Atxn3Q9CVD2 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Atxn3Q9CVD2 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Atxn3Q9CVD2 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Atxn3Q9CVD2 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Atxn3Q9CVD2 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Atxn3Q9CVD2 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Atxn3Q9CVD2 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Atxn3Q9CVD2 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Atxn3Q9CVD2 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Atxn3Q9CVD2 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Atxn3Q9CVD2 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Atxn3Q9CVD2 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Atxn3Q9CVD2 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Atxn3Q9CVD2 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Atxn3Q9CVD2 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Atxn3Q9CVD2 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Atxn3Q9CVD2 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Atxn3Q9CVD2 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Atxn3Q9CVD2 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Atxn3Q9CVD2 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Atxn3Q9CVD2 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Atxn3Q9CVD2 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Atxn3Q9CVD2 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Atxn3Q9CVD2 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Atxn3Q9CVD2 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Atxn3Q9CVD2 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Atxn3Q9CVD2 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Atxn3Q9CVD2 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Atxn3Q9CVD2 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Atxn3Q9CVD2 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC22.77■■□□□ 1.23
Atxn3Q9CVD2 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Atxn3Q9CVD2 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.23
Atxn3Q9CVD2 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Atxn3Q9CVD2 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Atxn3Q9CVD2 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Atxn3Q9CVD2 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Atxn3Q9CVD2 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Atxn3Q9CVD2 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Atxn3Q9CVD2 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Atxn3Q9CVD2 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Atxn3Q9CVD2 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Atxn3Q9CVD2 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Atxn3Q9CVD2 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Atxn3Q9CVD2 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Atxn3Q9CVD2 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Atxn3Q9CVD2 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Atxn3Q9CVD2 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Atxn3Q9CVD2 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Atxn3Q9CVD2 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Atxn3Q9CVD2 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Atxn3Q9CVD2 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Atxn3Q9CVD2 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Atxn3Q9CVD2 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Atxn3Q9CVD2 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Atxn3Q9CVD2 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Atxn3Q9CVD2 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Atxn3Q9CVD2 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Atxn3Q9CVD2 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Atxn3Q9CVD2 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Atxn3Q9CVD2 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Atxn3Q9CVD2 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Atxn3Q9CVD2 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Atxn3Q9CVD2 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms