Protein–RNA interactions for Protein: Q9CUI2

4930535I16Rik, RIKEN cDNA 4930535I16 gene (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930535I16RikQ9CUI2 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
4930535I16RikQ9CUI2 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
4930535I16RikQ9CUI2 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
4930535I16RikQ9CUI2 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
4930535I16RikQ9CUI2 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
4930535I16RikQ9CUI2 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
4930535I16RikQ9CUI2 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
4930535I16RikQ9CUI2 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
4930535I16RikQ9CUI2 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
4930535I16RikQ9CUI2 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
4930535I16RikQ9CUI2 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
4930535I16RikQ9CUI2 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
4930535I16RikQ9CUI2 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
4930535I16RikQ9CUI2 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
4930535I16RikQ9CUI2 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
4930535I16RikQ9CUI2 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
4930535I16RikQ9CUI2 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC11.42□□□□□ -0.58
4930535I16RikQ9CUI2 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
4930535I16RikQ9CUI2 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
4930535I16RikQ9CUI2 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC11.42□□□□□ -0.58
4930535I16RikQ9CUI2 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
4930535I16RikQ9CUI2 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
4930535I16RikQ9CUI2 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
4930535I16RikQ9CUI2 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
4930535I16RikQ9CUI2 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
4930535I16RikQ9CUI2 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
4930535I16RikQ9CUI2 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
4930535I16RikQ9CUI2 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
4930535I16RikQ9CUI2 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
4930535I16RikQ9CUI2 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
4930535I16RikQ9CUI2 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
4930535I16RikQ9CUI2 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
4930535I16RikQ9CUI2 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
4930535I16RikQ9CUI2 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
4930535I16RikQ9CUI2 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
4930535I16RikQ9CUI2 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
4930535I16RikQ9CUI2 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
4930535I16RikQ9CUI2 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
4930535I16RikQ9CUI2 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
4930535I16RikQ9CUI2 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
4930535I16RikQ9CUI2 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
4930535I16RikQ9CUI2 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
4930535I16RikQ9CUI2 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
4930535I16RikQ9CUI2 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
4930535I16RikQ9CUI2 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
4930535I16RikQ9CUI2 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
4930535I16RikQ9CUI2 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
4930535I16RikQ9CUI2 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
4930535I16RikQ9CUI2 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
4930535I16RikQ9CUI2 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
4930535I16RikQ9CUI2 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
4930535I16RikQ9CUI2 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
4930535I16RikQ9CUI2 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
4930535I16RikQ9CUI2 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
4930535I16RikQ9CUI2 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
4930535I16RikQ9CUI2 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
4930535I16RikQ9CUI2 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
4930535I16RikQ9CUI2 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
4930535I16RikQ9CUI2 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
4930535I16RikQ9CUI2 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
4930535I16RikQ9CUI2 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC11.41□□□□□ -0.58
4930535I16RikQ9CUI2 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
4930535I16RikQ9CUI2 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
4930535I16RikQ9CUI2 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
4930535I16RikQ9CUI2 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
4930535I16RikQ9CUI2 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
4930535I16RikQ9CUI2 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
4930535I16RikQ9CUI2 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
4930535I16RikQ9CUI2 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
4930535I16RikQ9CUI2 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
4930535I16RikQ9CUI2 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
4930535I16RikQ9CUI2 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
4930535I16RikQ9CUI2 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
4930535I16RikQ9CUI2 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
4930535I16RikQ9CUI2 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
4930535I16RikQ9CUI2 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
4930535I16RikQ9CUI2 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
4930535I16RikQ9CUI2 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
4930535I16RikQ9CUI2 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
4930535I16RikQ9CUI2 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
4930535I16RikQ9CUI2 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.58
4930535I16RikQ9CUI2 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
4930535I16RikQ9CUI2 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
4930535I16RikQ9CUI2 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
4930535I16RikQ9CUI2 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
4930535I16RikQ9CUI2 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.58
4930535I16RikQ9CUI2 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
4930535I16RikQ9CUI2 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
4930535I16RikQ9CUI2 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
4930535I16RikQ9CUI2 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
4930535I16RikQ9CUI2 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
4930535I16RikQ9CUI2 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
4930535I16RikQ9CUI2 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
4930535I16RikQ9CUI2 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
4930535I16RikQ9CUI2 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
4930535I16RikQ9CUI2 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
4930535I16RikQ9CUI2 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
4930535I16RikQ9CUI2 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
4930535I16RikQ9CUI2 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
4930535I16RikQ9CUI2 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.5 ms