Protein–RNA interactions for Protein: Q9CTG6

Atp13a2, Cation-transporting ATPase 13A2, mousemouse

Predictions only

Length 1,169 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp13a2Q9CTG6 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Atp13a2Q9CTG6 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Atp13a2Q9CTG6 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Atp13a2Q9CTG6 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Atp13a2Q9CTG6 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Atp13a2Q9CTG6 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Atp13a2Q9CTG6 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Atp13a2Q9CTG6 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Atp13a2Q9CTG6 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Atp13a2Q9CTG6 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Atp13a2Q9CTG6 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Atp13a2Q9CTG6 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Atp13a2Q9CTG6 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Atp13a2Q9CTG6 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Atp13a2Q9CTG6 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Atp13a2Q9CTG6 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Atp13a2Q9CTG6 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Atp13a2Q9CTG6 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Atp13a2Q9CTG6 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Atp13a2Q9CTG6 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Atp13a2Q9CTG6 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Atp13a2Q9CTG6 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Atp13a2Q9CTG6 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Atp13a2Q9CTG6 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Atp13a2Q9CTG6 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Atp13a2Q9CTG6 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Atp13a2Q9CTG6 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Atp13a2Q9CTG6 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Atp13a2Q9CTG6 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Atp13a2Q9CTG6 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Atp13a2Q9CTG6 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Atp13a2Q9CTG6 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Atp13a2Q9CTG6 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Atp13a2Q9CTG6 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Atp13a2Q9CTG6 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Atp13a2Q9CTG6 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Atp13a2Q9CTG6 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Atp13a2Q9CTG6 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Atp13a2Q9CTG6 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Atp13a2Q9CTG6 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Atp13a2Q9CTG6 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Atp13a2Q9CTG6 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Atp13a2Q9CTG6 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Atp13a2Q9CTG6 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Atp13a2Q9CTG6 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Atp13a2Q9CTG6 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Atp13a2Q9CTG6 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Atp13a2Q9CTG6 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Atp13a2Q9CTG6 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Atp13a2Q9CTG6 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Atp13a2Q9CTG6 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Atp13a2Q9CTG6 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Atp13a2Q9CTG6 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Atp13a2Q9CTG6 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Atp13a2Q9CTG6 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Atp13a2Q9CTG6 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Atp13a2Q9CTG6 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Atp13a2Q9CTG6 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Atp13a2Q9CTG6 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Atp13a2Q9CTG6 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Atp13a2Q9CTG6 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Atp13a2Q9CTG6 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Atp13a2Q9CTG6 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Atp13a2Q9CTG6 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Atp13a2Q9CTG6 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Atp13a2Q9CTG6 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Atp13a2Q9CTG6 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Atp13a2Q9CTG6 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Atp13a2Q9CTG6 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Atp13a2Q9CTG6 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Atp13a2Q9CTG6 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Atp13a2Q9CTG6 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Atp13a2Q9CTG6 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Atp13a2Q9CTG6 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Atp13a2Q9CTG6 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Atp13a2Q9CTG6 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Atp13a2Q9CTG6 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Atp13a2Q9CTG6 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Atp13a2Q9CTG6 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Atp13a2Q9CTG6 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Atp13a2Q9CTG6 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Atp13a2Q9CTG6 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Atp13a2Q9CTG6 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Atp13a2Q9CTG6 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Atp13a2Q9CTG6 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Atp13a2Q9CTG6 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Atp13a2Q9CTG6 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Atp13a2Q9CTG6 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Atp13a2Q9CTG6 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Atp13a2Q9CTG6 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Atp13a2Q9CTG6 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Atp13a2Q9CTG6 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Atp13a2Q9CTG6 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Atp13a2Q9CTG6 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Atp13a2Q9CTG6 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Atp13a2Q9CTG6 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Atp13a2Q9CTG6 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Atp13a2Q9CTG6 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Atp13a2Q9CTG6 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Atp13a2Q9CTG6 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms