Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR46

Ska2, Spindle and kinetochore-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 120 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ska2Q9CR46 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ska2Q9CR46 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Ska2Q9CR46 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ska2Q9CR46 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ska2Q9CR46 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ska2Q9CR46 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ska2Q9CR46 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ska2Q9CR46 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ska2Q9CR46 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ska2Q9CR46 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ska2Q9CR46 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ska2Q9CR46 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ska2Q9CR46 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ska2Q9CR46 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ska2Q9CR46 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ska2Q9CR46 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ska2Q9CR46 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ska2Q9CR46 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ska2Q9CR46 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ska2Q9CR46 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ska2Q9CR46 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ska2Q9CR46 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ska2Q9CR46 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ska2Q9CR46 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Ska2Q9CR46 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ska2Q9CR46 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Ska2Q9CR46 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ska2Q9CR46 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ska2Q9CR46 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ska2Q9CR46 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.46
Ska2Q9CR46 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Ska2Q9CR46 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Ska2Q9CR46 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ska2Q9CR46 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ska2Q9CR46 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ska2Q9CR46 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ska2Q9CR46 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ska2Q9CR46 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ska2Q9CR46 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ska2Q9CR46 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ska2Q9CR46 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ska2Q9CR46 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ska2Q9CR46 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ska2Q9CR46 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ska2Q9CR46 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ska2Q9CR46 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ska2Q9CR46 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ska2Q9CR46 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ska2Q9CR46 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ska2Q9CR46 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ska2Q9CR46 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ska2Q9CR46 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ska2Q9CR46 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ska2Q9CR46 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ska2Q9CR46 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ska2Q9CR46 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ska2Q9CR46 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ska2Q9CR46 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Ska2Q9CR46 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ska2Q9CR46 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ska2Q9CR46 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Ska2Q9CR46 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ska2Q9CR46 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ska2Q9CR46 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ska2Q9CR46 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ska2Q9CR46 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ska2Q9CR46 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ska2Q9CR46 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ska2Q9CR46 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ska2Q9CR46 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ska2Q9CR46 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ska2Q9CR46 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ska2Q9CR46 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ska2Q9CR46 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ska2Q9CR46 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ska2Q9CR46 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ska2Q9CR46 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ska2Q9CR46 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ska2Q9CR46 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ska2Q9CR46 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ska2Q9CR46 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ska2Q9CR46 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ska2Q9CR46 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ska2Q9CR46 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ska2Q9CR46 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ska2Q9CR46 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ska2Q9CR46 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ska2Q9CR46 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ska2Q9CR46 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ska2Q9CR46 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ska2Q9CR46 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ska2Q9CR46 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ska2Q9CR46 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ska2Q9CR46 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ska2Q9CR46 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ska2Q9CR46 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ska2Q9CR46 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ska2Q9CR46 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ska2Q9CR46 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ska2Q9CR46 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms