Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR05

4931417E11Rik, RIKEN cDNA 4931417E11, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4931417E11RikQ9CR05 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
4931417E11RikQ9CR05 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
4931417E11RikQ9CR05 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
4931417E11RikQ9CR05 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
4931417E11RikQ9CR05 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
4931417E11RikQ9CR05 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
4931417E11RikQ9CR05 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
4931417E11RikQ9CR05 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
4931417E11RikQ9CR05 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
4931417E11RikQ9CR05 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
4931417E11RikQ9CR05 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
4931417E11RikQ9CR05 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
4931417E11RikQ9CR05 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
4931417E11RikQ9CR05 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
4931417E11RikQ9CR05 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
4931417E11RikQ9CR05 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
4931417E11RikQ9CR05 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
4931417E11RikQ9CR05 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
4931417E11RikQ9CR05 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
4931417E11RikQ9CR05 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
4931417E11RikQ9CR05 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
4931417E11RikQ9CR05 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
4931417E11RikQ9CR05 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
4931417E11RikQ9CR05 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
4931417E11RikQ9CR05 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
4931417E11RikQ9CR05 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
4931417E11RikQ9CR05 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
4931417E11RikQ9CR05 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
4931417E11RikQ9CR05 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
4931417E11RikQ9CR05 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
4931417E11RikQ9CR05 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
4931417E11RikQ9CR05 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
4931417E11RikQ9CR05 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
4931417E11RikQ9CR05 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
4931417E11RikQ9CR05 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
4931417E11RikQ9CR05 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
4931417E11RikQ9CR05 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
4931417E11RikQ9CR05 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
4931417E11RikQ9CR05 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
4931417E11RikQ9CR05 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
4931417E11RikQ9CR05 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
4931417E11RikQ9CR05 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
4931417E11RikQ9CR05 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
4931417E11RikQ9CR05 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
4931417E11RikQ9CR05 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
4931417E11RikQ9CR05 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
4931417E11RikQ9CR05 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
4931417E11RikQ9CR05 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
4931417E11RikQ9CR05 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
4931417E11RikQ9CR05 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
4931417E11RikQ9CR05 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
4931417E11RikQ9CR05 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
4931417E11RikQ9CR05 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
4931417E11RikQ9CR05 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
4931417E11RikQ9CR05 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
4931417E11RikQ9CR05 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
4931417E11RikQ9CR05 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
4931417E11RikQ9CR05 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
4931417E11RikQ9CR05 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
4931417E11RikQ9CR05 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
4931417E11RikQ9CR05 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
4931417E11RikQ9CR05 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
4931417E11RikQ9CR05 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
4931417E11RikQ9CR05 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
4931417E11RikQ9CR05 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
4931417E11RikQ9CR05 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
4931417E11RikQ9CR05 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
4931417E11RikQ9CR05 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
4931417E11RikQ9CR05 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
4931417E11RikQ9CR05 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
4931417E11RikQ9CR05 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
4931417E11RikQ9CR05 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
4931417E11RikQ9CR05 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
4931417E11RikQ9CR05 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
4931417E11RikQ9CR05 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
4931417E11RikQ9CR05 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
4931417E11RikQ9CR05 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
4931417E11RikQ9CR05 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
4931417E11RikQ9CR05 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
4931417E11RikQ9CR05 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
4931417E11RikQ9CR05 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
4931417E11RikQ9CR05 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
4931417E11RikQ9CR05 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
4931417E11RikQ9CR05 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
4931417E11RikQ9CR05 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
4931417E11RikQ9CR05 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
4931417E11RikQ9CR05 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
4931417E11RikQ9CR05 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
4931417E11RikQ9CR05 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
4931417E11RikQ9CR05 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
4931417E11RikQ9CR05 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
4931417E11RikQ9CR05 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
4931417E11RikQ9CR05 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
4931417E11RikQ9CR05 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
4931417E11RikQ9CR05 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
4931417E11RikQ9CR05 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
4931417E11RikQ9CR05 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
4931417E11RikQ9CR05 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
4931417E11RikQ9CR05 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
4931417E11RikQ9CR05 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms