Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQX4

Pclaf, PCNA-associated factor, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 110 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PclafQ9CQX4 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PclafQ9CQX4 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PclafQ9CQX4 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PclafQ9CQX4 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PclafQ9CQX4 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PclafQ9CQX4 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PclafQ9CQX4 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PclafQ9CQX4 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PclafQ9CQX4 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PclafQ9CQX4 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PclafQ9CQX4 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PclafQ9CQX4 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PclafQ9CQX4 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PclafQ9CQX4 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PclafQ9CQX4 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
PclafQ9CQX4 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
PclafQ9CQX4 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PclafQ9CQX4 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PclafQ9CQX4 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PclafQ9CQX4 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PclafQ9CQX4 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PclafQ9CQX4 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PclafQ9CQX4 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
PclafQ9CQX4 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PclafQ9CQX4 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PclafQ9CQX4 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PclafQ9CQX4 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PclafQ9CQX4 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PclafQ9CQX4 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PclafQ9CQX4 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PclafQ9CQX4 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PclafQ9CQX4 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PclafQ9CQX4 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PclafQ9CQX4 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PclafQ9CQX4 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PclafQ9CQX4 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PclafQ9CQX4 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PclafQ9CQX4 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PclafQ9CQX4 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PclafQ9CQX4 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PclafQ9CQX4 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PclafQ9CQX4 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PclafQ9CQX4 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PclafQ9CQX4 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PclafQ9CQX4 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PclafQ9CQX4 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PclafQ9CQX4 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PclafQ9CQX4 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PclafQ9CQX4 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PclafQ9CQX4 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PclafQ9CQX4 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PclafQ9CQX4 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PclafQ9CQX4 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
PclafQ9CQX4 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PclafQ9CQX4 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PclafQ9CQX4 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PclafQ9CQX4 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PclafQ9CQX4 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PclafQ9CQX4 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
PclafQ9CQX4 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PclafQ9CQX4 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PclafQ9CQX4 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PclafQ9CQX4 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PclafQ9CQX4 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PclafQ9CQX4 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PclafQ9CQX4 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PclafQ9CQX4 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PclafQ9CQX4 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PclafQ9CQX4 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PclafQ9CQX4 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PclafQ9CQX4 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PclafQ9CQX4 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PclafQ9CQX4 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PclafQ9CQX4 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PclafQ9CQX4 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PclafQ9CQX4 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PclafQ9CQX4 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PclafQ9CQX4 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PclafQ9CQX4 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PclafQ9CQX4 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
PclafQ9CQX4 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PclafQ9CQX4 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PclafQ9CQX4 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PclafQ9CQX4 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PclafQ9CQX4 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PclafQ9CQX4 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PclafQ9CQX4 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PclafQ9CQX4 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PclafQ9CQX4 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PclafQ9CQX4 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PclafQ9CQX4 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PclafQ9CQX4 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PclafQ9CQX4 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
PclafQ9CQX4 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PclafQ9CQX4 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PclafQ9CQX4 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PclafQ9CQX4 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PclafQ9CQX4 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PclafQ9CQX4 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PclafQ9CQX4 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms